| 查看: 2924 | 回复: 6 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[求助]
高通量测序时，针对16S rRNA, 可以测不同的V区，我们确定V区的依据是什么呢？ 已有3人参与
|
|||
| 高通量测序时，针对16S rRNA, 可以测不同的V区，我们确定V区的依据是什么呢？ |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 微生物多样性 |
» 猜你喜欢
蛋白质检测：精准分析，解锁生物分子的密码
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之小鼠实验：严谨设计，解析生命机制的重要载体
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有118人回复
-
不合理蛙科研实验之重金属检测：精准筛查，守护健康与环境的防线
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“蛙测重金属我背锅三千”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“鼠逃三次我发三篇SCI”
已经有0人回复
-
纳米粒度分析
已经有3人回复
-
林科院林化所招收材料与化工专业硕士，坐标南京
已经有0人回复
-
留学--博士招生
已经有16人回复
-
化学工程，本211，求调剂，ab区不限
已经有4人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 16s RNA鉴定细菌测序需要多少钱
已经有12人回复
- 关于16s RNA测序
已经有3人回复
- 对细菌进行测序时，测的是16S rDNA还是16S rRNA
已经有25人回复
- 有没有比较快的,服务较好的高通量测序公司推荐?
已经有10人回复
- 关于16S rRNA基因绝对荧光定量的问题
已经有17人回复
- 16S测序结果不一样什么原因？
已经有7人回复
- 用16S测序鉴定单一菌株的困惑
已经有15人回复
- V2-V3 16S rRNA
已经有3人回复
- 哪个公司做16S的高通量测序好？
已经有8人回复
- 测序结果怎么分析
已经有9人回复
- 功能基因与16s rRNA基因
已经有3人回复
- 高通量测序分析微生物物种的丰度
已经有13人回复
- 转录组研究前沿
已经有21人回复
- 生物信息学专题－生物版，医学版和信息科学版共同创建
已经有87人回复
DoRbIr
金虫 (正式写手)
- 应助: 23 (小学生)
- 金币: 1525.6
- 红花: 3
- 帖子: 686
- 在线: 750.2小时
- 虫号: 875515
- 注册: 2009-10-17
- 性别: GG
- 专业: 微生物生态学
7楼2015-01-08 21:17:08
【答案】应助回帖
★ ★
感谢参与，应助指数 +1
huhaibing123: 金币+2, ★★★很有帮助 2014-07-15 17:25:56
感谢参与，应助指数 +1
huhaibing123: 金币+2, ★★★很有帮助 2014-07-15 17:25:56
|
您可以查看相关的文献。根据不同的测序仪，它们的测序的长度不同，所以您扩增的区域可能有点差别。而且不同V区的通用引物不同，我们要考虑通用引物的扩增效果好不好，这也是您考虑做哪个区域的考虑因素。您选择扩增区域的话，可以从通用引起扩增效果和区分效果去判断做哪个区域。 从我们以往分析过的大量样品来看，以V1-V3区分析效果很不错。相同样本V1-V3区PCR产物电泳检测亮度最高，且文献报道反向引物533R扩增的特异性及灵敏度更高；其次V1-V3区较其他V区长度更长，这样测序结果包含的物种的信息量就更大，物种分类的结果就更准确。 以上信息供您参考。 |
2楼2014-07-15 16:10:11
3楼2014-07-15 17:25:19
4楼2014-07-15 17:35:38
20