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newton-HIT

金虫 (初入文坛)

[求助] ion set Q at origin recip failure to write recip Q0错误解决方法 已有1人参与

linux版本的CASTEP在进行较大体系计算时(较多的k点或者声子计算)发生的错误提示:
Error: ion_set_Q_at_origin_recip: failure to write recip_Q0_save to page file
Current trace stack:
ion_set_Q_at_origin_recip
ion_int_Q_at_origin_recip
nlpot_calculate_d
band_structure_calculate_all
run_band_structure
castep
利用网络和帮助文档搜索了一下相关错误原因,一般认为是计算临时存储文件夹设置太小的原因(http://muchong.com/html/201104/3055044.html),建议修改计算临时文件存放位置。
于是按照帮助文件中的提示找到安装文件夹下面的~/share/bin/ms_setup.sh 发现默认的临时文件夹为/tmp.单位集群将该文件夹设置为10G,多人提交计算任务时的确容易造成文件夹占满。
修改其中的代码如下:
gatewaytmp="/home/msi/Accelrys/MaterialsStudio6.0/tmp"
I_MPI_MPD_TMPDIR=/home/msi/Accelrys/MaterialsStudio6.0/tmp
然后在安装账户相应的目录下建立tmp文件夹

重启后提交计算任务发现报错代码依旧,计算临时文件依然在根目录/tmp下,修改并不成功。求助修改成功达人指点迷津。
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北国故事

银虫 (正式写手)

请问最后怎么解决这个问题的?
4楼2024-12-30 17:21:18
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查看全部 4 个回答

四夕一

铁虫 (初入文坛)

请问楼主你解决这个问题了吗?可否具体说一下如何更改临时文件存放位置?万分感谢!!
2楼2015-12-24 10:52:10
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冯亚娟

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
2楼: Originally posted by 四夕一 at 2015-12-24 10:52:10
请问楼主你解决这个问题了吗?可否具体说一下如何更改临时文件存放位置?万分感谢!!

参考一下help 文档: DMol3 > DMol3 jobs > If a remote DMol3 job fails 或者CASTEP > CASTEP jobs > If a remote CASTEP job fails。
大体操作如下所示:
0. 使用管理员账户登录(root账户);
1. 服务器磁盘是否已满。 使用命令:df -h,查看是否有使用100%的磁盘;
2. 确定CASTEP临时文件的存储位置是否在占用100%的磁盘;locate ms_vars.sbd文件, ms_vars.sbd文件中GATEWAY_TMP内容,默认是/tmp
3. 将/tmp内容清空;使用命令:cd /tmp; rm -rf *
4. 如果 /tmp目录所在磁盘空间较小,可以更改GATEWAY_TMP目录至指定目录。
3楼2018-04-24 17:35:24
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