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newton-HIT金虫 (初入文坛)
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[求助]
ion set Q at origin recip failure to write recip Q0错误解决方法已有1人参与
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linux版本的CASTEP在进行较大体系计算时(较多的k点或者声子计算)发生的错误提示: Error: ion_set_Q_at_origin_recip: failure to write recip_Q0_save to page file Current trace stack: ion_set_Q_at_origin_recip ion_int_Q_at_origin_recip nlpot_calculate_d band_structure_calculate_all run_band_structure castep 利用网络和帮助文档搜索了一下相关错误原因,一般认为是计算临时存储文件夹设置太小的原因(http://muchong.com/html/201104/3055044.html),建议修改计算临时文件存放位置。 于是按照帮助文件中的提示找到安装文件夹下面的~/share/bin/ms_setup.sh 发现默认的临时文件夹为/tmp.单位集群将该文件夹设置为10G,多人提交计算任务时的确容易造成文件夹占满。 修改其中的代码如下: gatewaytmp="/home/msi/Accelrys/MaterialsStudio6.0/tmp" I_MPI_MPD_TMPDIR=/home/msi/Accelrys/MaterialsStudio6.0/tmp 然后在安装账户相应的目录下建立tmp文件夹 重启后提交计算任务发现报错代码依旧,计算临时文件依然在根目录/tmp下,修改并不成功。求助修改成功达人指点迷津。 |
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4楼2024-12-30 17:21:18
四夕一
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2楼2015-12-24 10:52:10
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- 专业: 原子和分子物理
【答案】应助回帖
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参考一下help 文档: DMol3 > DMol3 jobs > If a remote DMol3 job fails 或者CASTEP > CASTEP jobs > If a remote CASTEP job fails。 大体操作如下所示: 0. 使用管理员账户登录(root账户); 1. 服务器磁盘是否已满。 使用命令:df -h,查看是否有使用100%的磁盘; 2. 确定CASTEP临时文件的存储位置是否在占用100%的磁盘;locate ms_vars.sbd文件, ms_vars.sbd文件中GATEWAY_TMP内容,默认是/tmp 3. 将/tmp内容清空;使用命令:cd /tmp; rm -rf * 4. 如果 /tmp目录所在磁盘空间较小,可以更改GATEWAY_TMP目录至指定目录。 |
3楼2018-04-24 17:35:24













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