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liangyy10214

新虫 (小有名气)

[求助] 如何对多倍体的微卫星进行分析 已有1人参与

目前针对微卫星的分析软件好像都是适用于2倍体的,我做的是4倍体,该用什么软件分析呢,或者我的数据应该进行怎样的转换?求高手解答,最好能给两篇参考文献。谢谢!
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liangyy10214

新虫 (小有名气)

送红花一朵
对我更全面的了解SSR研究很有用,不过还是不能解决我的困惑,还是非常感谢!
2楼2014-07-10 15:27:17
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油条欢喜坨

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
liangyy10214: 金币+10, ★★★很有帮助, 没有完全解决我的问题,但非常有用。谢谢! 2014-07-11 09:04:36
有个软件可以分析4倍体的观测杂合度和香浓多样性指数。。另外,有研究表明,四倍体的微卫星数据直接转化成显性(基因型)数据,可能比依靠剂量判断的基因频率型的数据要来的准确一些。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

3楼2014-07-10 19:54:35
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油条欢喜坨

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

四倍体的数据可以转换成(0,1)矩阵后用进行分析
4楼2014-07-10 19:55:54
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liangyy10214

新虫 (小有名气)

送红花一朵
谢谢!有将碱基片段长度转换成(0,1)矩阵的软件么?转换后用什么软件分析呢?有没有相关的文献推荐一下?
5楼2014-07-10 21:36:08
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liangyy10214

新虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by 油条欢喜坨 at 2014-07-10 19:54:35
有个软件可以分析4倍体的观测杂合度和香浓多样性指数。。另外,有研究表明,四倍体的微卫星数据直接转化成显性(基因型)数据,可能比依靠剂量判断的基因频率型的数据要来的准确一些。

哪个软件啊?popgene?powermarker?
6楼2014-07-11 09:05:32
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kxs2001

金虫 (著名写手)

没看到答案
我知道,主爱我!
7楼2017-03-04 20:31:24
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