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fujishima

至尊木虫 (著名写手)

[交流] 用Gaussian算有机共轭大分子时,怎样构建分子的共轭键? 已有5人参与

用Gaussian算有机共轭大分子时,我用chemdraw线画出分子,在转换成Gaussian输入文件。我想问的是chemdraw画图时,共轭分子的键怎样设置,或者是不是不用设置,请各位帮帮忙啊
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fujishima

至尊木虫 (著名写手)

引用回帖:
10楼: Originally posted by yuliwang at 2014-07-10 07:49:11
我也用Gaussian算过,楼主说的共轭键等,就算你搭建了,结构优化之后也会变掉的,总的来说,共轭键在优化后的结构上是没有明显的单双键之分的,但是计算结果分析时,共轭结构对计算结果有很大的贡献,我马上有一篇文 ...

我就是想知道,用chemdraw画的结构式需要怎么调整?尤其是含有共轭环的分子。是直接画出来就行吗?还是要调整,怎么调整?我的分子是新东西,没有参考数据啊,所以键长键角都不知道。
或者说我画出一个苯环和画出一个环己三烯,算出来的结果是一样的吗?
12楼2014-07-10 10:46:52
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bittersmile

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
高斯输入只需要原子坐标。键只是我们虚构来理解化学的,不需要输入。
2楼2014-07-09 21:51:15
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oinkmasta

金虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
同楼上,键在高斯中只是方便你观察分子的,计算方面没有键也可以。
当然,如你要调整构型,还是有键看得清楚。是我的话就直接在高斯里面画分子了,不会花太久的。
16届本科在北美
3楼2014-07-09 22:42:47
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fujishima

至尊木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by bittersmile at 2014-07-09 21:51:15
高斯输入只需要原子坐标。键只是我们虚构来理解化学的,不需要输入。

也就是说,我在chemdraw里面画的单键,双键都没区别,只要他们的原子坐标是一样的就是一样的?

还有键长,键角是怎样确定的,是画好就可以的,还是要修改啊?
不知怎么改啊。
4楼2014-07-09 23:06:05
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