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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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zhpu2008

铜虫 (小有名气)

[求助] 关于荧光定量PCR扩增曲线的疑问 已有3人参与

各位大侠好,近两天做荧光定量PCR,但扩增曲线,有的正常,有的不正常,甚至是三个重复里面就差别较大,深蓝色是3个重复,浅蓝色是3个重复,有图附上,大家看看,帮忙分析原因,谢谢!

关于荧光定量PCR扩增曲线的疑问
quxian.jpg
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茂林修竹7

金虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
zhpu2008(西门吹雪170代发): 金币+5, 鼓励回帖交流 2014-06-28 13:05:06
Real Time PCR根据其原理,可以在PCR体系里加入荧光染料或者用特异性的荧光探针。我经常用的是前者,你的应该也是。
荧光染料法,对引物的要求还是挺高的,根据你的扩增曲线,排除加样过程中的误差,我认为 你的引物不好。
建议你做Relatime之前,最好先把引物检测一下。Relatime检测,就是一个引物准备两个上样孔,A.正常加样;B.把cDNA换成定量的H2O,看溶解曲线。好的引物溶解曲线,A孔只有一个峰,B孔没有峰。
另外加样的时候,最好混合一个体系,计算好用量,一个孔一个孔的分装,微量的如引物最好不要单独加,这样误差很大的。
图片是我做的,你可以参考下。
关于荧光定量PCR扩增曲线的疑问-1
扩增曲线.jpg


关于荧光定量PCR扩增曲线的疑问-2
溶解曲线.jpg

将欲取之必先与之
2楼2014-06-28 10:40:49
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Beryl_xu

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引用回帖:
2楼: Originally posted by 茂林修竹7 at 2014-06-28 10:40:49
Real Time PCR根据其原理,可以在PCR体系里加入荧光染料或者用特异性的荧光探针。我经常用的是前者,你的应该也是。
荧光染料法,对引物的要求还是挺高的,根据你的扩增曲线,排除加样过程中的误差,我认为 你的引 ...

做qPCR时候,设计引物之后,最好是要验证引物的非特异性(只有一个峰的溶解曲线),才能开始正式试验吧?
3楼2014-06-28 13:07:40
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茂林修竹7

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by Beryl_xu at 2014-06-28 13:07:40
做qPCR时候,设计引物之后,最好是要验证引物的非特异性(只有一个峰的溶解曲线),才能开始正式试验吧?...

是的。
将欲取之必先与之
4楼2014-06-28 20:12:56
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zhpu2008

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 茂林修竹7 at 2014-06-28 10:40:49
Real Time PCR根据其原理,可以在PCR体系里加入荧光染料或者用特异性的荧光探针。我经常用的是前者,你的应该也是。
荧光染料法,对引物的要求还是挺高的,根据你的扩增曲线,排除加样过程中的误差,我认为 你的引 ...

谢谢回复,溶解曲线都是单一的峰,只是扩增曲线异常,不知是何原因
5楼2014-06-29 20:30:08
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茂林修竹7

金虫 (正式写手)

★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流经验! 2014-07-15 15:55:31
引用回帖:
5楼: Originally posted by zhpu2008 at 2014-06-29 20:30:08
谢谢回复,溶解曲线都是单一的峰,只是扩增曲线异常,不知是何原因...

那就要考虑 反转录cDNA的质量和浓度了,我做Realtime是cDNA一般使用量是 100-200ng/孔(拟南芥材料)
将欲取之必先与之
6楼2014-06-30 07:57:33
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taccycle

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


gyesang: 金币+1, 鼓励回帖交流! 2014-07-15 15:55:39
依我看这个图是因为背景循环数和阈值设置的不好,你尝试更改一下阈值线和背景循环数看看
用心
7楼2014-07-01 15:19:17
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mumu1990

铜虫 (初入文坛)

你好,你的问题解决了吗?我最近做定量也出现了这个问题,想请教一下原因
8楼2014-08-08 17:16:53
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周硕

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

引用回帖:
8楼: Originally posted by mumu1990 at 2014-08-08 17:16:53
你好,你的问题解决了吗?我最近做定量也出现了这个问题,想请教一下原因

应该是这个基因的表达量太高了,建议再加大cDNA的稀释倍数。
9楼2014-10-11 09:13:37
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qq693989099

新虫 (初入文坛)

楼主问题最后怎么解决的啊
10楼2015-10-19 09:30:34
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