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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 计算模拟 » 想用遗传算法求解动力学参数
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飞鸿印雪jay

银虫 (小有名气)

[求助] 想用遗传算法求解动力学参数 已有2人参与

dCAdt =-k(1)*C(1)-k(2)*C(1)-k(3)*C(1);                  
dCBdt =k(1)*C(1)-k(4)*C(2)-k(5)*C(2);
dCCdt =k(2)*C(1)+k(4)*C(2)-k(6)*C(3);
dCDdt =k(3)*C(1)+k(5)*C(2)+k(6)*C(3);
请问怎么用遗传算法求解参数k啊，c的数值都是实验已知的，我用lsqnonlin求解，但是精度比较低。
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1楼 2014-06-22 21:12:43
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飞鸿印雪jay

银虫 (小有名气)
引用回帖:
9楼: Originally posted by dingd at 2014-06-23 13:46:02
1stOpt求解：

Parameter k(1:6)=;
Variable t,C1,C2,C3,C4;
ODEFunction
C1' =-k1*c1-k2*c1-k3*c1;
c2' =k1*c1-k4*c2-k5*c2;
c3' =k2*c1+k4*c2-k6*c3;
c4' =k3*c1+k5*c2+k6*c3;
Data;
0        0.877667262        0.1 ...

你好 请问为什么用上面的程序 用1stopt算不出来结果？
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12楼2014-06-27 11:15:33
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dingd

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
fegg7502: 金币+1, 3ks 2014-06-24 08:36:44
微分方程拟合问题建议试试1stOpt，论坛有不少类似案例，搜一下。其它数据有的话贴上来看看。
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2楼2014-06-22 22:15:49
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月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
fegg7502: 金币+1, 鼓励交流 2014-06-24 08:36:50
可以用GA算个初值，给lsqnonlin函数，这样的初值比较合理。
要是嫌麻烦，直接给出数据，让有高版本的1stopt的虫子跑一下也可以。
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MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助！时间精力有限，恕不接受无偿私信求助。
3楼2014-06-22 22:37:13
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飞鸿印雪jay

银虫 (小有名气)
★
fegg7502: 金币+1, 鼓励交流 2014-06-24 08:37:01
引用回帖:
2楼: Originally posted by dingd at 2014-06-22 22:15:49
微分方程拟合问题建议试试1stOpt，论坛有不少类似案例，搜一下。其它数据有的话贴上来看看。

format long
clear all
clc
tspan = [0  10  20  30  40  50  60 70  80  90  100  110  120];
x0 = [0.877667262        0.188437508        0.069051676        0.067639913];
k0 = [0  0  0  0  0  0];  
lb = [0  0  0  0  0  0];
ub = [+inf +inf +inf +inf +inf +inf];

data=[
0.683038504        0.34538674        0.138009043        0.135964027
0.398422967        0.413279625        0.203080312        0.189874719
0.266300405        0.468253074        0.289896419        0.348481733
0.142059055        0.397710816        0.305786676        0.424846321
0.068339284        0.34043909        0.335003128        0.497043462
0.049669997        0.312376889        0.351124377        0.609259358
0.025110016        0.237590973        0.335397788        0.723901322
0.012801963        0.197342301        0.32083196        0.736810004
0.005763427        0.156055501        0.306141448        0.834373408
0.002640872        0.10259385        0.238964753        0.755687994
0.001332663        0.091170321        0.248694235        0.903738353
0.004102735        0.066072318        0.220813975        0.917511998
];
yexp = data(:,1:4);

[k,resnorm,residual,exitflag,output,lambda,jacobian] =...
lsqnonlin(@ObjFunc,k0,lb,ub,[],tspan,x0,yexp);            
ci = nlparci(k,residual,jacobian);                          
fprintf('\n\n使用函数lsqnonlin()估计得到的参数值为:\n')      
fprintf('\tk1 = %.9f ± %.9f\n',k(1),ci(1,2)-k(1))         
fprintf('\tk2 = %.9f ± %.9f\n',k(2),ci(2,2)-k(2))  
fprintf('\tk3 = %.9f ± %.9f\n',k(3),ci(3,2)-k(3))  
fprintf('\tk4 = %.9f ± %.9f\n',k(4),ci(4,2)-k(4))  
fprintf('\tk5 = %.9f ± %.9f\n',k(5),ci(5,2)-k(5))  
fprintf('\tk6 = %.9f ± %.9f\n',k(6),ci(6,2)-k(6))  
%fprintf('\tk7 = %.9f ± %.9f\n',k(7),ci(7,2)-k(7))
%fprintf('\tk8 = %.9f ± %.9f\n',k(8),ci(8,2)-k(8))
%fprintf('\tk9 = %.9f ± %.9f\n',k(9),ci(9,2)-k(9))
%fprintf('\tk10 = %.9f ± %.9f\n',k(10),ci(10,2)-k(10))
fprintf('The sum of the squares is: %.9e\n\n',resnorm)

function f = ObjFunc(k,tspan,x0,yexp)                          
[t, Xsim] = ode45(@KineticsEqs,tspan,x0,[],k);
Xsim1=Xsim(:,1);
Xsim2=Xsim(:,2);
Xsim3=Xsim(:,3);
Xsim4=Xsim(:,4);
%Xsim5=Xsim(:,5);
%Xsim6=Xsim(:,6);
ysim(:,1) = Xsim1(2:end);
ysim(:,2) = Xsim2(2:end);
ysim(:,3) = Xsim3(2:end);
ysim(:,4) = Xsim4(2:end);
%ysim(:,5) = Xsim5(2:end);
%ysim(:,6) = Xsim6(2:end);
size(ysim(:,1));
size(ysim(:,2));
size(ysim(:,3));
size(ysim(:,4));
%size(ysim(:,5));
%size(ysim(:,6));
size(yexp(:,1));
size(yexp(:,2));
size(yexp(:,3));
size(yexp(:,4));
%size(yexp(:,5));
%size(yexp(:,6));
f = [(ysim(:,1)-yexp(:,1)) (ysim(:,2)-yexp(:,2)) (ysim(:,3)-yexp(:,3)) (ysim(:,4)-yexp(:,4)) ];%(ysim(:,5)-yexp(:,5))


function dCdt = KineticsEqs(t,C,k)                             
dCAdt =-k(1)*C(1)-k(2)*C(1)-k(3)*C(1);                       
dCBdt =k(1)*C(1)-k(4)*C(2)-k(5)*C(2);
dCCdt =k(2)*C(1)+k(4)*C(2)-k(6)*C(3);
dCDdt =k(3)*C(1)+k(5)*C(2)+k(6)*C(3);
dCdt = [dCAdt; dCBdt;dCCdt;dCDdt];
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4楼2014-06-23 00:09:40
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