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joyce79928

铜虫 (小有名气)

[求助] smeagol ERROR 已有2人参与

想请问一下
在计算smeagol时
output出现以下讯息

BulkTransport ERROR:
Overlap to second nearest slabs: 2
Increase the size of the unit cell along z.

我的.fdf是网路上Si的教学档
.psf是siesta网站上锁下载的LDA赝势

不知道问题到底出在哪里...
小女子求助大家了...
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joyce79928

铜虫 (小有名气)

我的结构是A,我已重复了我的结构六遍变成AAAAAA依然出现此结果
我也缩小了一点我的基函数,
原本我是使用default值(0.02Ry=272meV)
我缩小成200meV再算一次还是出现此错误
且我认为缩小基函数会造成不精准因此不希望降太多。

不知道大侠是否还有方法可以解决...
谢谢您了
7楼2014-06-17 15:23:34
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guohuazhong

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
joyce79928: 金币+1, 有帮助 2014-06-20 18:07:31
有可能是你的unit cell没取对。
2楼2014-06-15 09:24:59
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joyce79928

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by guohuazhong at 2014-06-15 09:24:59
有可能是你的unit cell没取对。

这是我网路上下载的fdf档
我有确认过这unit cell应该是没有错的...
不知道问题还有可能出在哪里呢?
谢谢
# -----------------------------------------------------------------------------
# FDF for silicon to use at Urbana School
# -----------------------------------------------------------------------------

SystemName          silicon       # System description
SystemLabel         silicon       # Label to be used for files
NumberOfAtoms       2
NumberOfSpecies     1

%block ChemicalSpeciesLabel
1  14  Si                        # For each specie, atomic number & symbol
%endblock ChemicalSpeciesLabel

LatticeConstant     5.430 Ang

%block LatticeVectors             # Lattice vectors in units of LatticeConstant
  0.500  0.500  0.000
  0.500  0.000  0.500
  0.000  0.500  0.500
%endblock LatticeVectors

AtomicCoordinatesFormat   ScaledCartesian  # How are the coordinates scaled

%block AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies
  0.000   0.000   0.000    1   Si
  0.250   0.250   0.250    1   Si
%endblock AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies
3楼2014-06-16 16:11:10
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joyce79928

铜虫 (小有名气)

以下是我的Si.out

siesta: System type = bulk      

siesta: k-grid: Number of k-points =     4
siesta: k-grid: Cutoff             =     3.840 Ang
siesta: k-grid: Supercell and displacements
siesta: k-grid:    2   0   0      0.500
siesta: k-grid:    0   2   0      0.500
siesta: k-grid:    0   0   2      0.500
siesta: overlap:  rmaxh   veclen  direction
siesta: overlap:  16.4146  7.2558   1
siesta: overlap:  rmaxh   veclen  direction
siesta: overlap:  16.4146  7.2558   2
siesta: overlap:  rmaxh   veclen  direction
siesta: overlap:  16.4146  7.2558   3
BulkTransport ERROR:
Overlap to second nearest slabs:    2
Increase the size of the unit cell along z.

是不是在KPOINTS有些問題?
4楼2014-06-16 16:38:09
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