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伊梦青lhq

新虫 (初入文坛)

[求助] PCR扩增跑胶 已有2人参与

各位大虾,求助啦!
我用提取的RNA进行反转录,然后用所得的cDNA进行PCR扩增。分别扩增了3个基因,c-myc,β-actin和hTERT,其中c-myc和β-actin都可以跑出条带,只有hTERT没有条带,做了三次,结果都是空白,胶上什么都没有,这是怎么回事,问题出在哪呢?
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伊梦青lhq

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
17楼: Originally posted by 逍潇 at 2014-06-20 13:58:39
检查引物我用的是http://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/...

根据您的建议,我做了退火梯度,温度分别是55,56,57,58,59,60,
20ul反应体系,反应条件是:94度 1min;(94度 30sec,53度 30 sec,72度 2min)*34个循环;72度 10min,并换了一种dNTP mixture ,由于之前跑的没有条带,我就稍稍增大了点模板量,由原来4ul/25ui增加为4ul/20ui跑胶结果就是上图。
hTERT F1 Tm=60.0度
          R1 Tm=61.9度
高兴的是它有条带了,但是结果不好,有弥散,只有退火温度在55,56时条带还比较明显。
我用的是TAE浓缩液差不多一年了,稀释后跑胶。
Mg离子是包含在试剂盒的buffer中,不是另外添加的。

高手帮忙再指导一下,是什么原因呢?谢谢啦!
PCR扩增跑胶
20140621112523.jpg

19楼2014-06-21 11:26:15
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逍潇

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
伊梦青lhq: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 学习了! 2014-06-11 10:39:41
你用的什么组织或细胞提的RNA?可能是引物出了问题?
2楼2014-06-09 18:30:28
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伊梦青lhq

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 逍潇 at 2014-06-09 18:30:28
你用的什么组织或细胞提的RNA?可能是引物出了问题?

HepG2 人肝癌细胞,其他的两个基因都可以跑出条带来的。
3楼2014-06-09 19:43:20
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逍潇

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 伊梦青lhq at 2014-06-09 19:43:20
HepG2 人肝癌细胞,其他的两个基因都可以跑出条带来的。...

检查一下引物的序列
4楼2014-06-09 20:37:12
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