查看: 3231  |  回复: 14

赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] 粗粒化模型建模之后分配力场问题 已有1人参与

各位,本人想模拟溶液粒子与聚合物的相互作用,聚合物想采用粗粒化模型,因此,溶液也粗粒化,先利用Amorphous Cell

建好溶液盒子,然后粗粒化,完之后就得分配力场了,问题来了,在分配力场之前,得先选中吧,如果是全原子粒子,直接

Edit/Atom selection就可以根据元素名称、等选中粒子,然后赋予力场。但是对于粗粒化,此法行不通,find patterns也不行。

总不能一个一个地点吧,各位大侠,请问如何选中,或者如何赋予力场呢?
回复此楼

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

zhenwuhuang

至尊木虫 (文学泰斗)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
赵红霞: 金币+30, ★★★★★最佳答案, 已经找到解决办法了,但是感谢你给我文献 2014-06-10 08:19:40
月只蓝: 金币+2, 鼓励交流! 2014-06-17 15:33:59
基于Martini力场架构的响应性聚合物刷的粗粒化分子模拟
http://cdmd.cnki.com.cn/Article/CDMD-10561-1012451446.htm
表面活性剂溶液行为的粗粒化模拟
http://www.doc88.com/p-949564828275.html
3楼2014-06-09 17:05:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhenwuhuang

至尊木虫 (文学泰斗)

【答案】应助回帖

★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-06-17 15:34:08
《软物质的计算机模拟与理论方法》(21世纪计算机化学丛书)(精)
4楼2014-06-09 17:09:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

我上图吧
图一为全原子模型时可以再Edit/Atom selection里选择。
图二为建立的粗粒化溶液盒子
粗粒化模型建模之后分配力场问题
1.png


粗粒化模型建模之后分配力场问题-1
2.png

2楼2014-06-09 16:59:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by zhenwuhuang at 2014-06-09 17:09:51
《软物质的计算机模拟与理论方法》(21世纪计算机化学丛书)(精)

多谢
5楼2014-06-10 16:47:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qq364085265

金虫 (著名写手)

送红花一朵
你好,请问您能帮我回答这些问题么
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=7563268#robot
我也是做介观模拟,想请教您,能加Q交流么?》
6楼2014-06-21 19:29:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

内容已删除

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

7楼2014-06-22 14:37:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qq364085265

金虫 (著名写手)

送红花一朵
内容已删除
8楼2014-06-22 18:25:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

venulove

新虫 (初入文坛)

有大神能帮忙解答现有参数怎么加入到力场里面
9楼2015-12-22 16:06:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

quzhou307

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 赵红霞 at 2014-06-22 14:37:48
我也是刚刚开始,加Q没问题,但是还不能回答问题,我怕误导你,我以前做小分子的,最近在摸索,总觉得粗粒化不准。你Q?...

你好,我刚开始接触介观模拟,想请教您,可以加您QQ吗?
10楼2016-09-13 16:18:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 Andsharia 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[有机交流] OpenAI又攻克数学难题了,离AI做有机合成还有多远? +8 wangyl_123 2026-10-10 12/600 2026-10-13 20:40 by Merryya
[硕博家园] 极限拉扯,如何抉择 +9 Isak0320 2026-10-12 13/650 2026-10-13 11:57 by Isak0320
[教师之家] 课题组会帮你通过考核么? +4 好运来~9527 2026-10-10 7/350 2026-10-13 08:41 by xli1984
[基金申请] 入职后第一次管课题组的专利缴费,对账才发现官费比别人多掏了一倍 +6 13108017953 2026-10-08 6/300 2026-10-12 20:07 by w3w3y3
[公派出国] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:34 by XQNyDCa1Tk5n
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 22:26 by XQNyDCa1Tk5n
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:26 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:15 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 22:11 by XQNyDCa1Tk5n
[教师之家] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:06 by XQNyDCa1Tk5n
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 14:25 by VOMexwnDzOFZ
[教师之家] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 (EPI+-1)(金币-50) +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 14:05 by VOMexwnDzOFZ
[考研] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:51 by VOMexwnDzOFZ
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:45 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:54 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:34 by VOMexwnDzOFZ
[考博] 招收博士生一名 +3 mandolin 2026-10-10 3/150 2026-10-11 10:21 by 不是山谷!
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 4/200 2026-10-11 03:14 by M0zrYVSAnxpE
[有机交流] 各位大佬,路线设计求助 +6 zapen 2026-10-08 8/400 2026-10-10 15:59 by zapen
[有机交流] 我应该选哪条合成路线让实验成功率高一些? +5 jing816y 2026-10-08 9/450 2026-10-10 09:05 by zapen
信息提示
请填处理意见