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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » QE(Pwscf) » pwscf并行计算错误
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zt_chem

木虫 (正式写手)

[求助] pwscf并行计算错误 已有1人参与

在对ZrO2的101面进行优化计算，计算过程中，固定下面几层原子，多核并行。计算出现stop1.查看.out文件发现在JOB DONE之后出现了下面的信息：
BAD TERMINATION OF YOUR APPLICATION PROCESSES
PID 20517 RUNING AT  centos6
EXIT CODE: 1
CLEANING UP REMAINING PROCESSES
YOU CAN IGNORE THE BELOW CLEANUP MESSAGES
不知道是不是并行环境没有编译好造成的
我是用mpiexec运行并行任务的
哪位知道，恳求指导！
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1楼 2014-06-08 09:43:25
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zt_chem

木虫 (正式写手)
送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by souledge at 2014-06-13 12:47:30
1. 在什么地方看到“最终结构”？如果是用relax，那会在每一个scf收敛后看到当前结构。如果是vc-relax，会在整个结构收敛后，再以收敛的结构进行一次scf计算，这时除了总能输出的地方，在SCF开头也能看到结构。
2 ...

问题解决了。主要计算模型输入不正确才引起了scf不能收敛。仔细核对了计算模型并调整后scf能收敛，任务正常结束.所说的提示没有出现。我是vc-relax优化的
谢谢您！
有问题再向您请教
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5楼2014-06-13 17:48:17
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souledge

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
zt_chem: 金币+10, ★有帮助, 先给10金币，呵呵 2014-06-13 10:33:19
zt_chem: 金币+40, ★★★很有帮助 2014-06-18 17:23:24
既然已经Job Done了，也有如下的消息了，就没必要担心什么了啊。
引用回帖:
YOU CAN IGNORE THE BELOW CLEANUP MESSAGES

这仅仅是多机并行添加的一个工作控制的反馈信息而已。
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思想重于技巧，内涵重于表象
2楼2014-06-13 09:23:24
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zt_chem

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by souledge at 2014-06-13 09:23:24
既然已经Job Done了，也有如下的消息了，就没必要担心什么了啊。

这仅仅是多机并行添加的一个工作控制的反馈信息而已。

谢谢您的回答！
我觉得还是有点问题。因为计算完成后无法看到最终优化得到得结构，要是正常结束.out文件是会显示最终优化结构的。
另外计算过程中发现scf能量波动，在达到设定的迭代次数后scf没有收敛。这个会不会也是出现提示的原因？
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3楼2014-06-13 10:32:41
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souledge

专家顾问 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by zt_chem at 2014-06-13 10:32:41
谢谢您的回答！
我觉得还是有点问题。因为计算完成后无法看到最终优化得到得结构，要是正常结束.out文件是会显示最终优化结构的。
另外计算过程中发现scf能量波动，在达到设定的迭代次数后scf没有收敛。这个会不 ...

1. 在什么地方看到“最终结构”？如果是用relax，那会在每一个scf收敛后看到当前结构。如果是vc-relax，会在整个结构收敛后，再以收敛的结构进行一次scf计算，这时除了总能输出的地方，在SCF开头也能看到结构。
2. scf的不收敛绝大多数情况下与计算参数有关，极少情况是编译器出了毛病，但是没听说并行会影响这个结果的……如果scf没有收敛，那肯定就不要想上面一条的“最终结构”了。
总而言之，上面的那个提示不过是一个计算机层面的错误提示，就相当于一个程序运行完后，返回值不是0一样，不能作为挖掘错误本源甚至不能作为是否判断有错的依据（那个错误提示自己翻译一下就知道，根本没有提到任何计算层面的东西）。如果要找是否有计算的问题，就需要回过头去仔细读一下.out是否有什么地方不对。
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zt_chem
思想重于技巧，内涵重于表象
4楼2014-06-13 12:47:30
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