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wyanyun

铁虫 (初入文坛)

[求助] 请帮忙设计荧光定量PCR引物 已有3人参与

因实验要求,需要设计一对专门针对人HPSE Transcript Variant 1(NM_006665.5)的特异性引物来做荧光定量PCR,可惜本人设计引物技术不佳,一直无法找到完全特异的引物,请各位出手相助,非常感谢!
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wangy0908

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
wyanyun(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励回帖交流 2014-06-11 18:55:06
利用beacon Designer软件设计吧,主要是你提供的目的序列特异不的,以及知道这段序列的结构吗?就是内含子和外显子区域,如果知道的话,就用两个外显子结合部进行设计的啊。这样得到的引物特异性会好一些的
4楼2014-06-11 17:19:49
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Neo2000

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
2楼: Originally posted by wyanyun at 2014-06-11 14:38:26
请各位帮忙!!

好设计,建议用primer-blast设计,好用

[ 发自小木虫客户端 ]
3楼2014-06-11 15:58:10
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wangweijian

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-06-12 13:03:45
可以用primer express 3 设计,软件应用简单,很快就能学会。beacon designer 应用比较复杂。
5楼2014-06-11 21:41:38
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wyanyun

铁虫 (初入文坛)

这个基因有4个剪切体,我已经设计好了针对后三个的特异引物,但是就这个最长的转录本,怎么都设计不出来非常特异的,怎么都会同时扩增其他的某个剪切体。我个人还是非常熟悉这些设计软件的,但是就这个剪切体怎么都设计不出特异的来。
6楼2014-06-12 14:30:34
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