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lzhhz

铜虫 (小有名气)

[交流] 三种初始结构得到三种不同的优化结构

最近用B3LYP/6-31G(d)计算一个有机分子（61个原子），用三种不同的初始结构去优化，分别得到三种稳定结构，频率计算都没有虚频，但频率计算中的收敛情况不太相同：
第一个
        Item                       Value             Threshold     Converged?     
Maximum Force               0.000711        0.000450       NO         
RMS     Force                  0.000096        0.000300       YES         
Maximum Displacement     0.001991        0.001800       NO         
RMS     Displacement        0.000481        0.001200       YES         
Predicted change in Energy=-1.430869D-06                 
第二个
         Item                        Value        Threshold    Converged?
Maximum Force               0.000282      0.000450       YES     
RMS     Force                  0.000041      0.000300       YES     
Maximum Displacement     0.009149      0.001800       NO      
RMS     Displacement        0.001289      0.001200       NO      
Predicted change in Energy=-2.911734D-06                       
第三个
        Item                       Value             Threshold     Converged?     
Maximum Force               0.000711        0.000450       NO         
RMS     Force                  0.000096        0.000300       YES         
Maximum Displacement     0.001991        0.001800       NO         
RMS     Displacement        0.000481        0.001200       YES         
Predicted change in Energy=-1.430869D-06   
其中第一个和第三个是一样的，可能是异构体，但都是两个NO，应该不是最稳定的结果，不知道该如何进一步优化。谢谢！
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1楼 2014-06-01 09:46:20
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xiaoamuchong

专家顾问 (职业作家)

科研工作者
O(∩_∩)O加油~。
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曾经有人问我为什么要学微生物，我只是想离生命的本质更近一点。
10楼2014-06-03 14:08:50
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qdykswang

金虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
gkf高: 金币+2 2014-06-06 09:39:05
1、你得到的三个优化后的结构的能量分别是多少？
2、调整频率计算都得到四个yes再看看。
3、如果三个结构都是稳定态，则取总能量最低的一个为优化结果。
4、一种化合物可能存在不同的分子结构，不同结构占的比例可能不同。

个人观点，望确认。
赞一下(1人) 回复此楼
化学工程+高分子
6楼2014-06-03 06:46:38
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dai_shen844

金虫 (小有名气)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
gkf高: 金币+2 2014-06-06 09:39:12
楼主可以根据三个优化结构中的最低能量构型，重新调整初始构型，再进行优化~
有时候会出现两个No，但是最终还是看最稳定态（能量和频率确定）吧，实在不行，建议scan一下~个人观点，仅供参考！
赞一下(2人) 回复此楼
潜心
9楼2014-06-03 13:39:39
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lzhhz

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by qdykswang at 2014-06-03 06:46:38
1、你得到的三个优化后的结构的能量分别是多少？
2、调整频率计算都得到四个yes再看看。
3、如果三个结构都是稳定态，则取总能量最低的一个为优化结果。
4、一种化合物可能存在不同的分子结构，不同结构占的比例 ...

最低能量是-1900.0899172，其他两个分别是是-1900.0834979和-1900.0881579。谢谢！
赞一下 回复此楼
11楼2014-06-05 15:43:28
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