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abinitio

版主 (著名写手)

[求助] 关于二元合金的偏径向分布函数 已有1人参与

由于原来始终做单质的MD,近期在做二元合金时,发现对偏径向分布函数还是理解的不够透彻,请各位高手指点一二。

cuzr合金,用lammpls 中的

①  compute        RDF all rdf 100  
fix            rdf all ave/time 100 1 100 c_RDF file d_rdf/rdf.${temp0} mode vector



② compute        PRDF all rdf 100 1 1 1 2 2 2
fix            prdf all ave/time 1 1 1 c_PRDF[1] c_PRDF[2] c_PRDF[3] c_PRDF[4] c_PRDF[5] c_PRDF[6] file d_prdf/prdf.${temp0} mode vector

计算得到了两组数据。

现在的问题是:
1. 上面的计算偏rdf的命令是否正确?
2. 两元中,计算总的rdf,即①中的方法是否还有意义?  
3. 计算得到的prdf,11 12 22 三个的值平均后,是否应该就是总的rdf? 即与①中的rdf相同吗?(实际得到是有区别的。)
关于二元合金的偏径向分布函数
请各位高手 不吝赐教,谢谢。
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xieluxielu

木虫 (著名写手)

天天

【答案】应助回帖

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感谢参与,应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-05-30 20:21:24
abinitio: 金币+2, 有帮助 2014-06-05 15:52:38
你可以用VMD算一下,对比

[ 发自小木虫客户端 ]
2楼2014-05-30 00:26:08
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