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cenwanglai荣誉版主 (知名作家)
老和山猥琐派九段
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[求助]
经典分子动力学软件DL_POLY结构优化优化的是什么?
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做好结构后,先做结构优化,CONTROL中写optim forces 0.2 很快就收敛了(timestep = 3~10). 现在问题是:FIELD中规定了分子内的键长,比如规定CO分子键长为1.2埃,初始结构CONFIG中设置C-O键长为1.5埃。做包含1000个CO分子的结构,在常温常压下结构优化。第二步就会把C-O键长优化到1.2埃? 结构优化应该是优化分子键的相互作用距离?或者对于大分子,优化分子的卷曲结构,而不是成键原子之间的键长? |
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