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paopaotu326金虫 (正式写手)
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差分电荷密度图的疑惑 已有6人参与
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大家好： 我是新手，刚学着做差分电荷密度，作出来的图如下所示： 我做的是掺杂体系，要看掺杂前后的电荷密度变化，我是分别计算出三个CHGCAR后直接在VESTA中相减的到的图片，不知道这个怎么分析啊？只知道红色区域表示电荷密度增大，蓝色减少，形成的键就不知道了，没学过量字化学啊，求高手帮忙下； 第二个问题就大了，同样的三个CHGCCAR文件，在linix系统中用脚本CHGdiff.pl来依次相减，就是ABC－A，得到一个结果，再用它－C＝chgdiff，放在vesta中显示，才好玩，和直接在vesta里相减得出的图完全不一样，如第二张图，这是怎么回事？ 我的体系是在SnO2中用Pd原子取代Sn原子形成的。  CHGCAR_vesta.jpg  CHGCAR.jpg |
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【答案】应助回帖
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franch: 金币+4, 谢谢回帖交流。。。 2014-06-10 09:10:58
franch: 金币+4, 谢谢回帖交流。。。 2014-06-10 09:10:58
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总结了下你的问题，回答如下： 1. 电荷差分需要是总的减去每个分的。也就是说ABC-A-B-C。其中A、B、C分别的需要做一下自洽，不需要进行结构优化。这个是针对你刚开始提出的ABC-A-C，我觉得在你的处理过程没有减去B，不知道是不是这样。 2. 如果要分析原子之间成键或者因为掺杂而导致的电荷转移不同，我不推荐用切片方法。用create isosurface可能会更直观一些。我用VESTA的时候直接给出的就是等高面，如果你的没有可以试试objects->volumetric data->show isosurfaces |
18楼2014-05-29 15:17:56
paopaotu326
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4楼2014-05-23 09:02:46
