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zengxianlei铁虫 (初入文坛)
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求解析hzo基因，amoA基因 已有2人参与
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| 我刚做厌氧氨氧化菌菌落多样性的研究，在查看文献中发现有人通过hzo基因来做的，也有人通过amoZ基因来做的，我们实验室偏向于通过16SrDNA来做。哪路高水能帮我比较一下这三种方案的优劣？ |
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quiller2000
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【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
zengxianlei: 金币+8, ★★★★★最佳答案 2014-05-26 19:07:13
zengxianlei: 金币+8, ★★★★★最佳答案 2014-05-26 19:07:13
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采用16S rDNA作为探针，得到的是微生物的种类组成，我们称之为群落结构。 采用amoA（AOA/AOB）和hzo,得到的序列是这两个酶的编码基因的一部分，反应的是代谢途径的多样性，我们称之为功能多样性。 一般情况下，我们需要将群落结构即微生物多样性与功能多样性进行比较分析，因为，存在这样的可能，即群落结构相似，但是代谢途径不同，或者活跃的代谢途径不同。 主流一点儿的技术，你应该做amoA和hzo在环境中的rna的丰度和组成分析，得到活跃的功能基因组成与丰度，从而实现对不同环境样品或者不同环境处理过程中，amoA及hzo的活跃程度和响应特征。 |
zengxianlei
7楼2014-05-23 16:30:24
quiller2000
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dllchina
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zengxianlei
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