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zengxianlei

铁虫 (初入文坛)

[求助] 求解析hzo基因,amoA基因已有2人参与

我刚做厌氧氨氧化菌菌落多样性的研究,在查看文献中发现有人通过hzo基因来做的,也有人通过amoZ基因来做的,我们实验室偏向于通过16SrDNA来做。哪路高水能帮我比较一下这三种方案的优劣?
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zengxianlei

铁虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
7楼: Originally posted by quiller2000 at 2014-05-23 16:30:24
采用16S rDNA作为探针,得到的是微生物的种类组成,我们称之为群落结构。

采用amoA(AOA/AOB)和hzo,得到的序列是这两个酶的编码基因的一部分,反应的是代谢途径的多样性,我们称之为功能多样性。

一般情况下 ...

多谢  小弟明白了
11楼2014-05-26 19:06:10
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quiller2000

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
laozuzunzhe: 金币+1, 鼓励应助! 2014-05-22 23:18:54
zengxianlei: 金币+2, 有帮助 2014-05-23 09:31:09
16S得到的是群落结构,两个还原酶基因得到的是功能结构,意义不同!

建议都做!实际上,现在肯定是都要求做的。
致良知
2楼2014-05-22 22:20:57
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dllchina

木虫 (著名写手)

有机的微生物大神

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
主流是AMO基因,A就是古菌?你只做古菌么~
3楼2014-05-22 23:56:51
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zengxianlei

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by quiller2000 at 2014-05-22 22:20:57
16S得到的是群落结构,两个还原酶基因得到的是功能结构,意义不同!

建议都做!实际上,现在肯定是都要求做的。

我的目的是分析微生物的多样性。不管是做功能基因还是做16S也都是分析其多样性。目的一样方法不一样,因此有没有方法上的优劣选择?不明白楼上所说'意义不同'。求解?
4楼2014-05-23 09:29:34
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