应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 求助：组氨酸质子化状态的问题
51/1返回列表
查看: 2554  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

fanghongmei

金虫 (初入文坛)

[求助] 求助：组氨酸质子化状态的问题 已有2人参与

本人现在打算跑分子动力学，需要确定蛋白大分子中组氨酸质子化状态，一遍更改为相应的残基名，请问各位大神，怎样才能确定这些组氨酸的质子化状态呢？请大家不吝赐教，非常感谢大家的帮忙
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

amber

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2014-05-17 10:42:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fanghongmei

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by aa7899379 at 2014-05-18 11:35:58
http://biophysics.cs.vt.edu/
上面这个网站可以计算氨基酸残基质子化状态；具体操作参见FAQs

非常感谢您的回复
赞一下 回复此楼
6楼2014-05-18 14:40:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

iamthinking

铁杆木虫 (正式写手)

浪客琴心

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
fanghongmei: 金币+3, ★有帮助 2014-05-18 14:43:13
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-05-30 18:54:07
可以用H++算一下，或者通常的查一下pH对应的质子化状态。

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
走马行酒醴，驱车布鱼肉~——咦，我的酒呢？
2楼2014-05-17 12:34:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fanghongmei

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by iamthinking at 2014-05-17 12:34:35
可以用H++算一下，或者通常的查一下pH对应的质子化状态。

您好，请问要在哪儿查pH对应的质子化状态，第一次做这样的例子，真的不知道该如何下手，非常感谢您的回复
赞一下 回复此楼
3楼2014-05-17 14:33:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

iamthinking

铁杆木虫 (正式写手)

浪客琴心
★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-05-30 18:54:12
引用回帖:
3楼: Originally posted by fanghongmei at 2014-05-17 14:33:32
您好，请问要在哪儿查pH对应的质子化状态，第一次做这样的例子，真的不知道该如何下手，非常感谢您的回复...

一般状况下也就是把HIS 改成HIP，HIE等，粗略的实际上对pH不敏感，质子化（酸性环境）的HIP，amber里面默认会改成HIE
赞一下 回复此楼
走马行酒醴，驱车布鱼肉~——咦，我的酒呢？
4楼2014-05-17 17:14:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭