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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 求助NAMD模拟后的结果如何处理
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神秘星球

木虫 (正式写手)

[求助] 求助NAMD模拟后的结果如何处理已有2人参与

求助NAMD模拟的结果分析的相关文献，书籍！

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0010
1楼2014-05-10 23:50:27
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神秘星球

木虫 (正式写手)
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0010
2楼2014-05-10 23:51:10
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神秘星球

木虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by yylcx at 2014-05-11 21:53:42
这个还是多看教程里面的案例啊，看案例怎么分析的

教程里面的基本都会了！

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0010
5楼2014-05-12 00:02:19
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神秘星球

木虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 915384165 at 2014-05-13 09:42:38
NAMD的结果处理
如果只是通常的计算，NAMD的输出文件一般主要只有两种格式， *.dcd（轨迹文件） *.log （日志文件）
一般我是使用VMD这个软件，来进行结果统计分析。这个软件及使用说明（建议看UG）可以在NAMD官网 ...

我在打开.vel文件出错了，上面显示inconsistent atom count.
我看官网上有一种解释是我的.vel文件可能不是二进制的，怎么判断文件是不是二进制的
那我该怎么降它转为二进制文件。
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0010
8楼2014-05-13 12:08:24
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神秘星球

木虫 (正式写手)
★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流 2014-05-16 19:50:45
引用回帖:
9楼: Originally posted by 915384165 at 2014-05-14 11:29:38
弱弱的问下 .vel 文件时干嘛用的？？？...

已经解决了！速度文件

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0010
10楼2014-05-14 14:33:28
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木虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 915384165 at 2014-05-13 09:42:38
NAMD的结果处理
如果只是通常的计算，NAMD的输出文件一般主要只有两种格式， *.dcd（轨迹文件） *.log （日志文件）
一般我是使用VMD这个软件，来进行结果统计分析。这个软件及使用说明（建议看UG）可以在NAMD官网 ...

顺便问一句，楼主有没有TCL文件的教程！

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0010
11楼2014-05-14 14:34:43
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