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那1022

铜虫 (初入文坛)

[求助] 细胞RNA提取一直失败 ,什么原因? 已有3人参与

新手,提取细胞RNA,连续几次都失败,不知问题出在哪里?
   具体步骤如下:
1) 6孔板,细胞汇合至90-100%,每孔加入1000ul trizol,反复吹打,使细胞溶解,室温静置5min。
2)将细胞的trizol裂解液转移至一1.5mlEP管中,加入200ul的氯仿/1000ul trizol,用手剧烈振摇15s,室温静置2-3min,4度  12000 转/分,离心15min。
3)吸取400ul上清转移至新的EP管中,加入500ul的异丙醇/1000ul trizol,上下摇晃3次,室温放置10min,4度 12000 转/分离心10min。
4)弃去上清(分别用大小枪头吸取),沉淀用1ml75%DEPC配制的乙醇溶液洗涤,4度 7500转/分 离心5min,
弃去乙醇溶液,加入20ul 0.1%的DEPC水溶解。
   
      按上述步骤, 连续几次提取时在加入异丙醇离心后都看不到沉淀,用75%乙醇洗涤后才见很小很小的白色沉淀,最终溶解后检测OD260/OD280基本都在1.6-1.7,电泳跑胶30分钟,只有加孔样孔发亮,或者加样孔下有很短的弥散。已经做了几次了,都是如此,不知道什么原因,请高手指点。
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那1022

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 飘落Oo天气 at 2014-05-12 23:15:38
感觉你裂解细胞时没弄好,我提DNA用CTAB 60度裂解40分钟,其间多次用漩涡混匀器剧烈震荡。
提取RNA 直接加液氮在研本里面磨碎的。或者加 trizol 用破碎机破碎10分钟以上。

嗯,确实是裂解的时间不够,后来又做了一次,加入 trizol 后裂解了15分钟,就提出来了。谢谢!
7楼2014-05-13 12:36:51
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biot

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-05-13 12:52:50
是不是使用的东西没有灭菌,有RNAase?再就是乙醇没有吸干净,有残留

[ 发自小木虫客户端 ]
扬帆起航!
3楼2014-05-10 08:10:33
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飘落Oo天气

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-05-13 12:52:56
感觉你裂解细胞时没弄好,我提DNA用CTAB 60度裂解40分钟,其间多次用漩涡混匀器剧烈震荡。
提取RNA 直接加液氮在研本里面磨碎的。或者加 trizol 用破碎机破碎10分钟以上。
4楼2014-05-12 23:15:38
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那1022

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by gyesang at 2014-05-09 22:42:04
1. trizol试剂是哪个公司的,是否是真品,市场上有很多高仿trizol

2. “弃去乙醇溶液,加入20ul 0.1%的DEPC水溶解。”
这一步弃去乙醇溶液后,需要将沉淀晾干,然后加入DEPC处理水

3. 电泳时,用相对较高的电 ...

谢谢版主。  用的 trizol试剂是国产的,不过学姐之前用它提动物组织都没问题。我后来又做一次,将细胞裂解时间延长至15分钟,就提出来了。
5楼2014-05-13 12:35:15
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