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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 药效团模型的建立
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xiaoxuancao

银虫 (小有名气)

[求助] 药效团模型的建立 已有1人参与

本人第一次接触这个东东，想构建一个小分子的药效团，但只有一个已知活性的分子，并且其作用方式已知，听说可以自己进行定义药效团，然后对数据库进行筛选，但具体的怎么做还不知道。看其他资料好像都是由一系列已知活性的化合物进行叠合来构建的，请大神们指点一二，不甚感激
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1楼 2014-05-09 10:26:31
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blue_cat

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
xiaoxuancao: 金币+1, ★有帮助 2014-05-11 22:17:07
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流 2014-05-16 19:30:14
如果你的活性分子的药效构象已知可以手动建立药效团模型
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DS
2楼2014-05-10 16:23:52
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xiaoxuancao

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by blue_cat at 2014-05-10 16:23:52
如果你的活性分子的药效构象已知可以手动建立药效团模型

我用的sybyl8.0，可以手动构建吗？具体怎么操作，还有如果建好之后怎么验证模型的合理性呢，怎么用这个模型来进行虚拟筛选，zinc数据库该怎么下载，问题多多，呵呵
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3楼2014-05-11 22:22:11
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倩430

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by xiaoxuancao at 2014-05-11 22:22:11
我用的sybyl8.0，可以手动构建吗？具体怎么操作，还有如果建好之后怎么验证模型的合理性呢，怎么用这个模型来进行虚拟筛选，zinc数据库该怎么下载，问题多多，呵呵...

我也要作何你一样的东西，和你遇到的问题都差不多，我也不咋会，帮你定下嘿嘿
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4楼2014-05-12 15:05:08
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