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clown9111014

银虫 (小有名气)

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10楼: Originally posted by jpchou at 2014-05-26 15:29:17
同意

差分只是後處理
vasp or castep 都能得到 charge density

得到 charge density 就可以做差分
vasp 可以用 lev00 做差分
castep 要用... ? 這我就不知了

若是能自己寫 code,就沒有這種困擾嘍...

好吧,谢谢你们了!!!
努力学习 必有所获
11楼2014-05-26 20:03:40
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Joannaouc

木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
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9楼: Originally posted by clown9111014 at 2014-05-26 16:21:07
是这样的,castep不能直接输出差分后的电荷密度,也不能输出单个原子的密度文件,所以要用lev000做差只能用vasp输出的结果,这样差分电荷密度图就是vasp得出的,而电荷密度分布是由castep得出的,会不会不准确呀! ...

我还是没有理解。电荷密度分布已经由castep得出,做个简单的数学计算就能得到差分,为什么还要用lev000做差分?
12楼2014-05-27 10:28:55
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clown9111014

银虫 (小有名气)

引用回帖:
12楼: Originally posted by Joannaouc at 2014-05-27 10:28:55
我还是没有理解。电荷密度分布已经由castep得出,做个简单的数学计算就能得到差分,为什么还要用lev000做差分?...

你好,不知你能否得出差分电荷密度数据,不是图,是数据,如果你会请教教我,先谢啦!!
努力学习 必有所获
13楼2014-05-27 20:15:11
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clown9111014

银虫 (小有名气)

引用回帖:
12楼: Originally posted by Joannaouc at 2014-05-27 10:28:55
我还是没有理解。电荷密度分布已经由castep得出,做个简单的数学计算就能得到差分,为什么还要用lev000做差分?...

是这样的,我有电荷密度的三维数据,xyz坐标和电荷密度,做差分要减去对应原子未成键状态电荷,可是要怎么获得这一数据呢,castep好像不能直接给出,而vasp可以给出的。
努力学习 必有所获
14楼2014-05-27 20:22:44
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Joannaouc

木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
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14楼: Originally posted by clown9111014 at 2014-05-27 21:22:44
是这样的,我有电荷密度的三维数据,xyz坐标和电荷密度,做差分要减去对应原子未成键状态电荷,可是要怎么获得这一数据呢,castep好像不能直接给出,而vasp可以给出的。...

我明白了,你要做的是deformation density而不是大家所认为的density difference。 CASTEP是不能做这个任务,dmol可以,我不知道VASP也可以做这个。

这样的话可以用VASP来计算deformation density,结果不会差太多。
15楼2014-05-28 10:03:18
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clown9111014

银虫 (小有名气)

引用回帖:
15楼: Originally posted by Joannaouc at 2014-05-28 10:03:18
我明白了,你要做的是deformation density而不是大家所认为的density difference。 CASTEP是不能做这个任务,dmol可以,我不知道VASP也可以做这个。

这样的话可以用VASP来计算deformation density,结果不会差太 ...

对,我感觉也是,密度图看不出来
努力学习 必有所获
16楼2014-05-28 14:58:37
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May.Be

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
我就是用VASP算的,然后在VESTV中画图的
17楼2014-05-28 16:15:10
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clown9111014

银虫 (小有名气)

引用回帖:
17楼: Originally posted by May.Be at 2014-05-28 16:15:10
我就是用VASP算的,然后在VESTV中画图的

真的啊,请问你是否得到了电荷密度数据,就是xyz和对应电荷密度值
努力学习 必有所获
18楼2014-05-28 17:36:31
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无所谓K

新虫 (初入文坛)


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楼主,最终答案是什么呢,如何导出差分电荷密度的数据?求解
19楼2014-09-23 21:12:56
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
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16楼: Originally posted by clown9111014 at 2014-05-28 14:58:37
对,我感觉也是,密度图看不出来...

castep可以做形变电荷密度(一次差分),atomic density直接得到的就是,差分电荷密度(二次差分)需要指定sets of atoms。

你看看check2xsf将castep的check文件导出是否能够导出为vasp格式之后再进行lev00作图?http://muchong.com/html/201301/5406515.html

另外还有就是把MS下做到的图贴到Origin下面的Matrix绘制成矢量图,但是我觉得效果不好。
不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
20楼2014-09-24 11:05:18
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