遗传图谱构建和QTL定位的相关方法（书籍和文献） - 农林 - 农林综合

11楼2015-01-13 05:57:35

hgweiweicz

12楼2015-01-19 15:56:57

zck0316

金虫 (小有名气)

应助: 1 (幼儿园)
金币: 793.4
红花: 1
帖子: 125
在线: 42.9小时
虫号: 1367713
注册: 2011-08-13
性别: GG
专业: 作物分子育种

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖

楼主好人，我做的是F1群体，目前看到有人用WinQTLcart完成了QTL，我想问下到底这个软件能不能完F1的QTL

小时候大人告诉我们，我们是祖国未来的花朵，可为什么最后长成了一朵朵奇葩！

13楼2015-04-01 17:18:14

dudusdau

木虫 (正式写手)

应助: 3 (幼儿园)
金币: 1950.4
散金: 1020
红花: 3
帖子: 312
在线: 246.8小时
虫号: 1107138
注册: 2010-09-25
性别: GG
专业: 遗传学与生物信息学

引用回帖:

13楼: Originally posted by zck0316 at 2015-04-01 17:18:14
楼主好人，我做的是F1群体，目前看到有人用WinQTLcart完成了QTL，我想问下到底这个软件能不能完F1的QTL

你好，WinQTLcart是支持F1代的，你可以阅读说明书 38 页 Cross Information。另外，不知道你构建连锁遗传图谱用的是什么标记？标记量是多少，如果是高密度遗传图谱，单标记分析是可以的。 R package qtl 也可以完成 F1代的QTL分析。

14楼2015-04-02 13:15:47

zck0316

金虫 (小有名气)

应助: 1 (幼儿园)
金币: 793.4
红花: 1
帖子: 125
在线: 42.9小时
虫号: 1367713
注册: 2011-08-13
性别: GG
专业: 作物分子育种

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖

引用回帖:

14楼: Originally posted by dudusdau at 2015-04-02 13:15:47
你好，WinQTLcart是支持F1代的，你可以阅读说明书 38 页 Cross Information。另外，不知道你构建连锁遗传图谱用的是什么标记？标记量是多少，如果是高密度遗传图谱，单标记分析是可以的。 R package qtl 也可以完成 ...

用了ssr est-ssr srap issr 这几种标记，150个位点，不算高密度

小时候大人告诉我们，我们是祖国未来的花朵，可为什么最后长成了一朵朵奇葩！

15楼2015-04-02 13:45:05

dudusdau

木虫 (正式写手)

应助: 3 (幼儿园)
金币: 1950.4
散金: 1020
红花: 3
帖子: 312
在线: 246.8小时
虫号: 1107138
注册: 2010-09-25
性别: GG
专业: 遗传学与生物信息学

引用回帖:

15楼: Originally posted by zck0316 at 2015-04-02 13:45:05
用了ssr est-ssr srap issr 这几种标记，150个位点，不算高密度...

那你就只能选用区间作图或者复合区间作图之类的了，用WinQTLcart可以的，你可能需要仔细看看说明书了，R包的使用需要一定的R语言基础，这个难度可能大点。你是山农的吗？

16楼2015-04-02 14:06:47

zck0316

金虫 (小有名气)

应助: 1 (幼儿园)
金币: 793.4
红花: 1
帖子: 125
在线: 42.9小时
虫号: 1367713
注册: 2011-08-13
性别: GG
专业: 作物分子育种

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖

引用回帖:

16楼: Originally posted by dudusdau at 2015-04-02 14:06:47
那你就只能选用区间作图或者复合区间作图之类的了，用WinQTLcart可以的，你可能需要仔细看看说明书了，R包的使用需要一定的R语言基础，这个难度可能大点。你是山农的吗？...

是山农的，你咋知道的·？

小时候大人告诉我们，我们是祖国未来的花朵，可为什么最后长成了一朵朵奇葩！

17楼2015-04-02 16:43:15