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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » QE(Pwscf) » 调试PWscf程序时出现以下错误信息，请高手帮忙
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huhq

银虫 (小有名气)

[求助] 调试PWscf程序时出现以下错误信息，请高手帮忙 已有2人参与

测试LDA+U的算例时，出现以下错误信息，是何原因？
。。。。。
Atomic wfc used for LDA+U Projector are NOT orthogonalized
     Starting wfc are   20 atomic wfcs

     total cpu time spent up to now is        4.1 secs

     per-process dynamical memory:    35.6 Mb

     Self-consistent Calculation

     iteration #  1     ecut=    30.00 Ry     beta=0.30
     Davidson diagonalization with overlap
     ethr =  1.00E-02,  avg # of iterations =  3.3

=====================================================================================
=   BAD TERMINATION OF ONE OF YOUR APPLICATION PROCESSES
=   EXIT CODE: 139
=   CLEANING UP REMAINING PROCESSES
=   YOU CAN IGNORE THE BELOW CLEANUP MESSAGES
=====================================================================================
APPLICATION TERMINATED WITH THE EXIT STRING: Segmentation fault (signal 11)
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1楼 2014-05-01 22:12:45
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

c_chi

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by huhq at 2014-05-06 14:59:21
可能是内存不够，如果只在gamma点计算没有问题。但，不知如何判断内存是否够用？如不够用如何处理？谢谢。...

有个ulimit参数，不限制就是ulimit -s unlimited，试一下看行不行
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5楼2014-05-06 15:48:35
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c_chi

木虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by huhq at 2014-05-06 15:55:24
该参数可能应该在哪个文件中？谢谢...

写在提交任务的脚本中即可，或者在运行程序前运行这段语句就行
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7楼2014-05-06 16:04:01
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pangrui1985

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
9楼: Originally posted by huhq at 2014-05-07 08:21:46
请教一下，如何改堆栈设置内？...

百度一下ulimit ，最好把所有的都不设限
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10楼2014-05-07 17:00:27
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普通回帖

c_chi

木虫 (正式写手)
是不是内存不够，堆栈溢出？
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2楼2014-05-05 12:33:20
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huhq

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by c_chi at 2014-05-05 12:33:20
是不是内存不够，堆栈溢出？

可能是内存不够，如果只在gamma点计算没有问题。但，不知如何判断内存是否够用？如不够用如何处理？谢谢。
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3楼2014-05-06 14:59:21
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pangrui1985

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by huhq at 2014-05-06 14:59:21
可能是内存不够，如果只在gamma点计算没有问题。但，不知如何判断内存是否够用？如不够用如何处理？谢谢。...

有权限的话改堆栈设置，百度一下就有。
然后增加并行的核数也可以
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4楼2014-05-06 15:37:43
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huhq

银虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by c_chi at 2014-05-06 15:48:35
有个ulimit参数，不限制就是ulimit -s unlimited，试一下看行不行...

该参数可能应该在哪个文件中？谢谢
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6楼2014-05-06 15:55:24
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huhq

银虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by c_chi at 2014-05-06 16:04:01
写在提交任务的脚本中即可，或者在运行程序前运行这段语句就行...

好的，谢谢！
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8楼2014-05-07 08:11:52
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huhq

银虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by pangrui1985 at 2014-05-06 15:37:43
有权限的话改堆栈设置，百度一下就有。
然后增加并行的核数也可以...

请教一下，如何改堆栈设置内？
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9楼2014-05-07 08:21:46
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