24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 3119  |  回复: 8
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

summermio

新虫 (初入文坛)

[求助] 同源重组阳性单菌落问题 已有2人参与

最近在做同源重组, 想把一个荧光蛋白的基因整合到大肠杆菌基因组的某个地方里, 用的是 red recombinase. 好不容易筛选到几个阳性菌落后做菌落PCR, 引物选用construct上下游的各一段基因,可是每个单菌落pcr出来都有两条带, 一条大小2kb,恰好是整合进去的结果,一条是300bp(类似WT的结果), 是没整合进去的意思。 我以为是单菌落不纯, 于是用验证过的阳性单菌落再涂reduction plate, 再挑单菌落pcr得出来的结果还是混合2kb条带和300bp条带的结果,为啥一个单菌落里会有两种基因型呢????各位大侠有什么解释和办法么,,,好不容易有一个结果~~~(>_<~~~
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

summermio

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by meng_xu at 2014-04-30 05:32:16
嗯,是不是基因组里其他地方有类似的序列呢?染色体重组做的少,不过有篇不错的文章,不知道你看了没有
One-step inactivation of chromosomal genes in Escherichia coli K-12 using PCR products
Kirill A. Dat ...

必须看了呀。基本就是按着这个做的。
我觉得可能性比较小, 不太可能基因组其他位置的序列pcr扩出来的片段连大小(300bp)也和正确位置的一样吧。。
3楼2014-04-30 18:52:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

meng_xu

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2014-04-30 10:41:25
嗯,是不是基因组里其他地方有类似的序列呢?染色体重组做的少,不过有篇不错的文章,不知道你看了没有
One-step inactivation of chromosomal genes in Escherichia coli K-12 using PCR products
Kirill A. Datsenko and Barry L. Wanner 2000 PNAS vol 97 6640–6645
2楼2014-04-30 05:32:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhaodahe

木虫 (正式写手)

不知道你转化的DNA是线型还是环形?筛选压力是什么?同源片段如何设计的?

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
4楼2014-04-30 21:03:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

summermio

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by zhaodahe at 2014-04-30 21:03:37
不知道你转化的DNA是线型还是环形?筛选压力是什么?同源片段如何设计的?

线型 大概是这样   5‘--同源区----要加进去的基因--FRT---Kanamycin---FRT---同源区3’    大约共2kb 把这个construct接到一个基因组中一个基因的5’端
筛选压力 Kanamycin 40ug/ml
同源区 前后各45bp
5楼2014-04-30 21:36:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] 有没有接收比较快的sci期刊呀,最好在一个月之内的,研三孩子求毕业 20+4 之护着 2026-04-16 6/300 2026-04-19 13:00 by Aaron_zyn
[考研] 327求调剂 +27 Xxjc1107. 2026-04-13 30/1500 2026-04-19 08:22 by cuisz
[考研] 0854求调剂 +23 门路摸摸 2026-04-15 27/1350 2026-04-19 01:59 by 烟雨流涯
[考研] 300求调剂 +12 橙a777 2026-04-15 12/600 2026-04-18 23:51 by 路病情
[考研] 291求调剂 +10 关忆北. 2026-04-14 10/500 2026-04-18 23:32 by 路病情
[考研] 生物学调剂 +10 纸扇zhishan 2026-04-13 10/500 2026-04-18 21:19 by zqndavala
[考研] 320求调剂 +5 深郊akm 2026-04-17 5/250 2026-04-18 19:52 by 王珺璞
[考研] 化学070300 求调剂 +29 哈哈哈^_^ 2026-04-12 29/1450 2026-04-18 15:56 by Equinoxhua
[考研] 收到复试调剂但是去不了 +8 小蜗牛* 2026-04-16 8/400 2026-04-18 11:15 by zixin2025
[考研] 304求调剂 +7 castLight 2026-04-16 7/350 2026-04-17 20:05 by 关一盏灯cd
[有机交流] 二苯甲酮酸类衍生物 50+3 小白爱主人 2026-04-17 6/300 2026-04-17 18:47 by kf2781974
[考研] 322求调剂 +6 tekuzu 2026-04-17 6/300 2026-04-17 13:48 by Espannnnnol
[考研] 一志愿沪9,生物学326求调剂 +9 刘墨墨 2026-04-15 9/450 2026-04-16 17:14 by 崔崔崔cccc
[考研] 297,工科调剂?河南农业大学本科 +14 河南农业大学-能 2026-04-14 14/700 2026-04-16 14:41 by dingyanbo1
[考研] 26药学专硕105500求调剂 +6 喽哈加油 2026-04-13 7/350 2026-04-16 14:31 by zhouxiaoyu
[考博] 申博自荐 +3 Linxia林夏 2026-04-13 3/150 2026-04-16 12:55 by 墨荷之露
[考研] 药学求调剂 +14 喽哈加油 2026-04-14 16/800 2026-04-16 10:15 by beilsong20
[考研] 求调剂学校 +14 不会吃肉 2026-04-13 16/800 2026-04-15 21:59 by noqvsozv
[考研] 085600材料与化工349分求调剂 +16 李木子啊哈哈 2026-04-12 17/850 2026-04-14 09:11 by fenglj492
[考研] 2026硕士调剂_能动_河南农业大学 +4 河南农业大学-能 2026-04-12 4/200 2026-04-13 22:01 by bljnqdcc
信息提示
请填处理意见