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yongning88

铜虫 (小有名气)

[求助] 势函数的构件 已有1人参与

我按照文献中的公式和参数计算了一下pair-potentiial, 算出的值和文献中给出的图一样(如图3所示),可为什么当 r 小于1.5 A 时,对势就很大(如图5所示),文献中没给出这部分的值,而LAMMPS中给出的势文件却是有个峰值的(如图4所示)。跪求大牛们的帮助。

势函数的构件
function.PNG


势函数的构件-1
parmeters.PNG


势函数的构件-2
pair_potential_in-paper.PNG


势函数的构件-3
pair_potential_for_LAMMPS.PNG


势函数的构件-4
pair_potenial_in_paper.PNG
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ChemiAndy

木虫 (正式写手)


★ ★ ★
月只蓝: 金币+3, 鼓励交流 2014-05-16 20:11:27
引用回帖:
10楼: Originally posted by yongning88 at 2014-05-05 15:14:56
对于我问题中给出的对势公式和拟合出来的参数值,我用MATLAB从r=0开始算了下,如图5所示,这个关于r的函数就没有峰值,也就是从无穷大趋向于零。如果我要用这个公式来建立一个势函数文件,需要从r=0,dr=0.0134A, ...

貌似楼主的主要困惑是他得到的势能曲线在 r< 0.67 下与文献结果不一致。特别是,paper给出的曲线是无穷大,但LAMMPS得到的却是向下的。各位回答强调6<0.67A下没有意义,因为实际模拟当中原子间距不可能这么小,但是,仍然没有解决楼主的困惑。

我的意见是你的计算中肯定有哪个地方出错了,或者没有完全理解文献的意思。比如,你给出的图3和图5,势能最低点明显不一致。图5很可能只是用来作者用来示意势能函数中排斥部分的。如果加上吸引部分,总势能很有可能得到类似你图4的曲线,但我也不确信你的matlab计算是否完全follow了文献的公式。图2参数表给出的参数,有几个明显没有出现在图1的公式当中,你是否遗漏了什么?
11楼2014-05-12 08:11:56
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lsloneil

专家顾问 (正式写手)

你是如何用lammps得到图4和图5的?
2楼2014-04-29 10:31:08
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yongning88

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lsloneil at 2014-04-29 10:31:08
你是如何用lammps得到图4和图5的?

这个不是用LAMMPS得到的,是用MATLAB 算的,我是想自己构架那个可以在LAMMPS中用的势函数
3楼2014-04-29 10:37:08
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fanarsenal

木虫 (正式写手)


月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-04-30 13:22:50
mark一下。
楼主的那张图跟文献一样?我觉得从这个尺度看哪有一样的,或者楼主标清楚一下图几。。。
最好把文献贴出来,帖子里面只放自己的图。
4楼2014-04-30 09:37:56
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