24小时热门版块排行榜    

查看: 1821  |  回复: 23
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

yongning88

铜虫 (小有名气)

[求助] 势函数的构件 已有1人参与

我按照文献中的公式和参数计算了一下pair-potentiial, 算出的值和文献中给出的图一样(如图3所示),可为什么当 r 小于1.5 A 时,对势就很大(如图5所示),文献中没给出这部分的值,而LAMMPS中给出的势文件却是有个峰值的(如图4所示)。跪求大牛们的帮助。

势函数的构件
function.PNG


势函数的构件-1
parmeters.PNG


势函数的构件-2
pair_potential_in-paper.PNG


势函数的构件-3
pair_potential_for_LAMMPS.PNG


势函数的构件-4
pair_potenial_in_paper.PNG
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ChemiAndy

木虫 (正式写手)


★ ★ ★
月只蓝: 金币+3, 鼓励交流 2014-05-16 20:11:27
引用回帖:
10楼: Originally posted by yongning88 at 2014-05-05 15:14:56
对于我问题中给出的对势公式和拟合出来的参数值,我用MATLAB从r=0开始算了下,如图5所示,这个关于r的函数就没有峰值,也就是从无穷大趋向于零。如果我要用这个公式来建立一个势函数文件,需要从r=0,dr=0.0134A, ...

貌似楼主的主要困惑是他得到的势能曲线在 r< 0.67 下与文献结果不一致。特别是,paper给出的曲线是无穷大,但LAMMPS得到的却是向下的。各位回答强调6<0.67A下没有意义,因为实际模拟当中原子间距不可能这么小,但是,仍然没有解决楼主的困惑。

我的意见是你的计算中肯定有哪个地方出错了,或者没有完全理解文献的意思。比如,你给出的图3和图5,势能最低点明显不一致。图5很可能只是用来作者用来示意势能函数中排斥部分的。如果加上吸引部分,总势能很有可能得到类似你图4的曲线,但我也不确信你的matlab计算是否完全follow了文献的公式。图2参数表给出的参数,有几个明显没有出现在图1的公式当中,你是否遗漏了什么?
11楼2014-05-12 08:11:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 24 个回答

lsloneil

专家顾问 (正式写手)

你是如何用lammps得到图4和图5的?
2楼2014-04-29 10:31:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yongning88

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lsloneil at 2014-04-29 10:31:08
你是如何用lammps得到图4和图5的?

这个不是用LAMMPS得到的,是用MATLAB 算的,我是想自己构架那个可以在LAMMPS中用的势函数
3楼2014-04-29 10:37:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fanarsenal

木虫 (正式写手)


月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-04-30 13:22:50
mark一下。
楼主的那张图跟文献一样?我觉得从这个尺度看哪有一样的,或者楼主标清楚一下图几。。。
最好把文献贴出来,帖子里面只放自己的图。
4楼2014-04-30 09:37:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 科研人应该花精力去思考如何解决问题,而不是去凝练问题 +7 瞬息宇宙 2026-09-01 14/700 2026-09-02 17:33 by ma0526
[基金申请] 要骂人了,新模版改版就是要淡化问题凝练这种虚的东西,结果有个评委还在说凝练得不够 +9 瞬息宇宙 2026-08-31 17/850 2026-09-02 14:04 by anjeeshine
[基金申请] 学科评审组评审是指会评吗? +5 瞬息宇宙 2026-08-31 5/250 2026-09-02 10:13 by 雨冰共舞
[文学芳草园] 梦想 +5 myrtle 2026-08-26 8/400 2026-09-02 02:42 by Leogzhya
[基金申请] 面上合作单位盖章 +6 ssyjh 2026-08-27 9/450 2026-09-01 20:01 by huagongfeihu
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高,自己申请怎么就这么难 +13 Kittylucky 2026-08-27 14/700 2026-09-01 11:06 by feng6531
[论文投稿] 小白求助 投论文要求的highlights应该如何写 5+3 l1963982152 2026-08-29 4/200 2026-09-01 09:04 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见(F口面上) +7 gdd2018 2026-08-28 12/600 2026-09-01 08:32 by 尼古拉斯小虫
[基金申请] 国社科又开始会评了,不知道这次命运如何 +7 雨打竹帘 2026-08-30 11/550 2026-08-31 23:16 by hittle2008
[基金申请] 面上意见出来了 +12 黄鸟于飞Chao 2026-08-29 23/1150 2026-08-31 18:57 by 黄鸟于飞Chao
[基金申请] 能否申诉? +7 echo8914667 2026-08-30 8/400 2026-08-31 17:00 by yihongxu
[基金申请] 中青基了要发朋友圈吗? +7 349506619 2026-08-28 7/350 2026-08-31 13:39 by 冼亮淀粉酶
[基金申请] 29号明天会评吗 +4 笨笨唐 2026-08-28 4/200 2026-08-31 09:30 by huixian257
[基金申请] 为什么到现在没收到通知? +5 tannykie 2026-08-29 5/250 2026-08-30 21:05 by purplejack
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +7 德尚中行 2026-08-27 8/400 2026-08-30 20:52 by purplejack
[考博] 找导师 +6 yuanjiabao 2026-08-29 7/350 2026-08-30 14:40 by 生科新手
[基金申请] 我就是申请一个面上项目而已,这评审意见是按照杰青的条件评的吧? +6 gouxfjh 2026-08-28 11/550 2026-08-30 07:57 by gouxfjh
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +4 bud_bud 2026-08-27 7/350 2026-08-29 07:23 by foolishmani
[基金申请] 看板上这么多中的,有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
信息提示
请填处理意见