24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
查看: 1762  |  回复: 13
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

亮剑随风

金虫 (小有名气)

[求助] 高斯opt+fre运算老出错,求高人指点已有1人参与

现把我的gjf和log文件附上,恳请高斯方面的高人帮忙给看看。。。到底是构型方面的问题还是结构太大的原因?新人刚接触高斯计算,本科毕业设计到现在还没啥进展。
回复此楼

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : BL-03.log
  • 2014-04-25 14:58:47, 126.17 K
  • 附件 2 : BL-03.gjf
  • 2014-04-25 15:02:27, 3.85 K

» 猜你喜欢

庸者常立志,智者立长志!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

我做出来π-π作用就出现了,三个那么大的苯环。。。。。你的初始结构很不好,我把优化好的结构重新做成gjf,你按照你自己的内存和cpu核心数对mem和nproc进行修改吧。这个结构你可以优化,也可以把gjf的opt去掉。

我优化采用的是先通过am1粗略优化,然后在逐个从lsda/3-21g,wB97xd/3-21+g,wB97xd/6-31+g*进行优化,这个你知道就可以了,单纯为了节约时间。

你还是再考虑一下我说的,到底为什么用wb97xd而不是b3lyp,或有更好的XC泛函选择,你可以在这个基础上继续做。提示一下,这个其实和DFT通常讨论的问题相关,如果必要你可以参考Sob博士的帖子,额外再去查阅相关的文献。按说这些问题都是你们毕业课题指导老师应该和你说清楚的,随便让学生一算太不负责。

另外,你自己应该养成查阅资料的习惯,关于gaussian不收敛网上很多人做过总结,逐一排查逐一解决,这个是你毕业论文应该做的。

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : BL-03.gjf
  • 2014-04-27 16:54:44, 3.85 K
不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
14楼2014-04-27 17:03:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 14 个回答

FoggyEM

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
最后一个原子坐标
H                  0.93815032    2.73869541    1.45776498
两个回车,然后把后面的数据都删掉。应该就可以了。

也就是这样
……(原子坐标)
H                  0.93815032    2.73869541    1.45776498
回车
回车
(剩下的都删了)
Everysinglestepoftheway,Ipaid.
2楼2014-04-25 15:39:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

Convergence failure的信息。
看样子scf没收敛,我还没用gview看一下,造成这些问题的有可能是结构不合理或是其他原因暂时还不好判断。

另外建议做计算过程在计算参数这一行采用#p来显示详细的迭代信息,这样便于我们进行诊断,另外建议保存chk文件,它储存了很多波函数的信息,一来便于分析,二来就是read check是一种常用的scf收敛技巧。

另外站内有g09的中文手册最好看一下,借助毕业论文的机会了解一下量子化学这个领域开开眼界也不错,否则这个毕业论文就是浪费时间了。

结构似乎比较大,我可以尝试帮你做个预优化,达到6-31+g*的水平,其他的你自己来。我认为这么大的体系做频率分析4cores估计有些困难。

本科毕业论文要求不能太高。。。。
不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
3楼2014-04-25 15:49:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

亮剑随风

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by FoggyEM at 2014-04-25 15:39:08
最后一个原子坐标
H                  0.93815032    2.73869541    1.45776498
两个回车,然后把后面的数据都删掉。应该就可以了。

也就是这样
……(原子坐标)
H                  0.93815032    2.73869 ...

好的!我试一下
庸者常立志,智者立长志!
4楼2014-04-25 16:14:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
信息提示
请填处理意见