24小时热门版块排行榜    

查看: 2877  |  回复: 26
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

mantou满

铁虫 (初入文坛)

[求助] Fukui函数与Population analysis

本人初次接触Dmol3,在看密立根电荷时应用Fukui function和Population analysis都能得到密立根电荷的数值,但是有差别,请问差别在哪里?请各大虫指点迷津~
回复此楼
生活不易吖。。。。
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

引用回帖:
22楼: Originally posted by 夏陌86℃ at 2014-10-09 16:35:49
由于刚接触MS计算,可以再弱弱的问一下,怎么手工计算呢,多谢多谢...

优化完结构,得到布居分析,Hirshfeld或Mulliken,之后在此结构计算能量(不进行结构优化),计算+1电荷(spin unrestricted)以及-1电荷的布居分析,每个原子电荷布居对应作差即可。
不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
23楼2014-10-09 17:29:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 27 个回答

卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

★ ★ ★
gmy1990: 金币+3 2014-04-23 16:27:34
做个不恰当但是直观的比喻,电荷相当于位移,Fukui function就相当于速度。

假设中性分子的某原子Mulliken电荷为q,Mulliken电荷表示的Fukui函数指的是dq/dN,但是左右导数不是相同的dq/dN(+)和dq/dN(-)有各自的意义,与活性变化相关,来自于电负性均衡原理,徐光宪的中册的密度泛函章节有简单介绍。关于活性位点和电荷分析可参考Sob博士的帖子,有更多的描述,甚至可以直接咨询,他是这方面专家。

一般直接求f(+)、f(-)的导数通常是通过有限差分近似,但是尤其要小心的是Dmol3中的差分电荷是0.01而不是1,在很多低档次的文章我都见过相关错误,详细参见Dmol3的Fukui function的help部分。
不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
2楼2014-04-23 14:56:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mantou满

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 卡开发发 at 2014-04-23 14:56:49
做个不恰当但是直观的比喻,电荷相当于位移,Fukui function就相当于速度。

假设中性分子的某原子Mulliken电荷为q,Mulliken电荷表示的Fukui函数指的是dq/dN,但是左右导数不是相同的dq/dN(+)和dq/dN(-)有各自的 ...

那Population analysis得到的Mulliken电荷呢?
生活不易吖。。。。
3楼2014-04-23 19:29:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

★ ★ ★
gmy1990: 金币+3 2014-04-24 15:25:59
引用回帖:
3楼: Originally posted by mantou满 at 2014-04-23 19:29:09
那Population analysis得到的Mulliken电荷呢?...

得到原子电荷q有很多种方法,其中一种是Mulliken,是一种分子中将原子间区域的电子对半分的方案(表述的不精确)。因为对于电子尺寸而言,其波动性不可忽略,为了简化描述分子上电荷的分布,就把电荷按照一定方式划分归属到原子,就是原子电荷布居分析。划分电荷的方案很多,fukui又是原子电荷的导数,所以Fukui函数计算时,应该指明采用的布居方法。Dmol3支持的方案有Hirshfeld和Mulliken两种布居分析,对应就有两种Fukui函数。
不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
4楼2014-04-23 21:54:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
信息提示
请填处理意见