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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 怎样用能量和温度判断体系达到收敛了？（600ps水盒子温度波动还很大）
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月只蓝

主管区长 (职业作家)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
upc穆宁: 金币+2 2014-04-23 21:01:11
Another way to check if a structure has equilibrated is to start the calculation with different initial conformations and different initial velocities. Convergence to similar conformations and properties from different initial values is a good indicator that equilibration has occurred.
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MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助！时间精力有限，恕不接受无偿私信求助。
21楼2014-04-22 20:33:49
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hanhan1020

木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
10楼: Originally posted by upc穆宁 at 2014-04-22 10:02:59
对呀，但是前面几楼都说是平衡了，这是什么原因呢？...

光看图可以认为是平衡了可是你设置的真是277？应该收敛都收敛于设定值
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没有读不下的书，只有不努力的自己。
22楼2014-04-22 21:55:48
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lixiaofei001

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
upc穆宁: 金币+2 2014-04-23 16:24:25
引用回帖:
12楼: Originally posted by upc穆宁 at 2014-04-22 10:06:03
但是体系没有达到设定的温度这样可以吗？...

你设定的温度一定是正确的么？或者你的这种数据状态将长期处于这种几乎为常数的状态。。。
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开心，是一天；不开心，也是一天！所以。。结果都一样，不如选择开心的那一天！
23楼2014-04-23 10:08:55
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upc穆宁

新虫 (小有名气)
引用回帖:
16楼: Originally posted by pigrass at 2014-04-22 11:12:41
你把thermostat按我回复设置下...

那是不是nose-hoover方法，达到平衡时体系的温度可能并不是设定温度？
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24楼2014-04-23 16:20:08
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upc穆宁

新虫 (小有名气)
引用回帖:
17楼: Originally posted by pigrass at 2014-04-22 11:13:11
一般dynamic看能量平衡体系基本就平衡了

那如果看能量的话，能量平衡是指能量差为多少呢？
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25楼2014-04-23 16:21:19
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
24楼: Originally posted by upc穆宁 at 2014-04-23 16:20:08
那是不是nose-hoover方法，达到平衡时体系的温度可能并不是设定温度？...

这个你要看nose-hoover的控温原理

我只是觉得velocity scale控温更直观 可以直接设定温度波动幅度
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#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
26楼2014-04-23 16:31:23
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
引用回帖:
25楼: Originally posted by upc穆宁 at 2014-04-23 16:21:19
那如果看能量的话，能量平衡是指能量差为多少呢？...

能量平衡不会是绝对的直线
平衡到最后能量波动很小
我的理解是可以算最高最低能量差除以平均值
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upc穆宁
#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
27楼2014-04-23 16:33:14
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upc穆宁

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
27楼: Originally posted by pigrass at 2014-04-23 16:33:14
能量平衡不会是绝对的直线
平衡到最后能量波动很小
我的理解是可以算最高最低能量差除以平均值...

恩，谢谢了。刚才我有用forcite模块试了一下，同样的参数设置，温度结果就收敛到设置温度了，不知道为什么？
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28楼2014-04-23 17:08:22
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
upc穆宁: 金币+2 2014-04-23 21:00:56
引用回帖:
28楼: Originally posted by upc穆宁 at 2014-04-23 17:08:22
恩，谢谢了。刚才我有用forcite模块试了一下，同样的参数设置，温度结果就收敛到设置温度了，不知道为什么？...

只是控温方式不同罢了 这个也不叫收敛 只是强制让温度在1K范围波动

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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29楼2014-04-23 17:40:22
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upc穆宁

新虫 (小有名气)
引用回帖:
21楼: Originally posted by 月只蓝 at 2014-04-22 20:33:49
Another way to check if a structure has equilibrated is to start the calculation with different initial conformations and different initial velocities. Convergence to similar conformations and proper ...

版主好，我又用forcite模块重新做了一下，同样的设置，但是这次温度就收敛在设定温度值，不知道为什么？用discover模块，温度低很多
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30楼2014-04-23 21:02:54
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