| 查看: 3093 | 回复: 12 | |||
[求助]
ts找到过渡态，可以把做irc两端的点提出来优化作为反应物和产物的稳定结构么？ 已有2人参与
|
|||
|
已知反应物和产物的结构，用的是ts的办法找到的过渡态，然后做irc各做了40个点，发现确实往反应物和产物的方向跑了。所以停掉，用各自的最后一个点拿出来再优化，得到了反应物和产物的结构。但是这个结构和我之前单独优化的结构构型是有差别的，角度啊，二面角什么的。请问各位前辈可以用irc的结果这么找反应物和产物么？ ps:算的双分子反应，所以是把A+B放在作为一个输入文件优化的，上面用irc的点优化走出来的构型和之前单独优化的构型不一样。（这个构型主要指两个分子的相对空间位置不一样，A分子和B分子的构型都是没差别的。）还有一个问题：用不同的方法和不同的基组，优化出来的A+B的构型也不一样，这个是正常的么？ 希望各位前辈给予指点，完全的新手，也没人指导，都是自己瞎琢磨的。 |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 计算化学 |
» 猜你喜欢
博士生招生, 材料模拟方向，University of South Carolina
已经有1人回复
-
Tc数据拟合
已经有1人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有230人回复
-
韩国釜山大学储能电池与功能材料实验室诚招博后（电池/电化学/器件制备/MOF合成）
已经有187人回复
-
祈福！
已经有79人回复
-
散金求好运
已经有315人回复
-
博士生招生, 材料模拟方向，University of South Carolina
已经有0人回复
-
Postdoc position, materials simulations/machine learning, U. of South Carolina
已经有0人回复
-
祈福青基
已经有34人回复
-
牛来！米来！面来！
已经有8人回复
-
2027申博咨询
已经有11人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- IRC计算结束后如何接着计算
已经有3人回复
- 为啥我用gaussian跑的IRC图会是这样？
已经有9人回复
- 寻找过渡态，走IRC产物方向与反应物方向相反,如何寻找正确的过渡态？
已经有11人回复
- 请问IRC跑出来的反应物与优化的反应物不同怎么办？
已经有4人回复
- IRC出错~求解，急！
已经有14人回复
- 过渡态qst2的问题
已经有7人回复
- irc是做什么的？
已经有9人回复
- 对irc得到的结构是否可以（or 需要）作进一步结构优化？
已经有7人回复
- 关于irc restart的一个问题
已经有5人回复
- 高斯09寻找过渡态，急需帮助，十分感谢
已经有6人回复
- IRC计算方向的问题
已经有12人回复
- IRC得出来的能量图起点和终点一定是反应物和产物么？
已经有5人回复
- 过渡态优化，iop(1/8=1),能量曲线依然震荡，我还要hold住吗？
已经有17人回复
- IRC中的stepsize，急
已经有5人回复
- 计算的朋友快来帮忙，IRC扫描错误问题，急急急！
已经有11人回复
- TS方法计算过渡态出现的问题
已经有14人回复
- 【求助】这个irc曲线正常吗？
已经有16人回复
- 【求助】IRC计算问题
已经有16人回复
- 【求助】零点能ZPE校正使过渡态能量低于反应物络合物中间体？
已经有3人回复
- 【求助】IRC只向反应物方向跑是什么原因？
已经有16人回复
- 【求助】过渡态qst2没算完怎么接着继续算？
已经有10人回复
- 【求助】过渡态能量竟然比反应物和产物还低
已经有9人回复
yurivivi8楼2014-04-21 18:09:41
9楼2014-04-23 10:40:45
wangsihang
木虫 (正式写手)
- 应助: 74 (初中生)
- 金币: 2281.4
- 红花: 5
- 帖子: 649
- 在线: 185.3小时
- 虫号: 1261538
- 注册: 2011-04-11
- 专业: 催化化学
2楼2014-04-19 22:09:57
yypcnbe
木虫 (小有名气)
- 应助: 36 (小学生)
- 金币: 3500.2
- 红花: 5
- 帖子: 198
- 在线: 2185.2小时
- 虫号: 1245634
- 注册: 2011-03-26
- 性别: GG
- 专业: 催化化学
3楼2014-04-20 17:39:38
4楼2014-04-20 20:01:50
5楼2014-04-20 20:07:51
TINGLI_广
木虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1785.1
- 散金: 10
- 红花: 3
- 帖子: 235
- 在线: 72.1小时
- 虫号: 1952141
- 注册: 2012-08-23
- 性别: MM
- 专业: 工程热物理相关交叉领域
6楼2014-04-21 09:25:36
7楼2014-04-21 15:59:20
|
计算反应的活化能，肯定不能放在一起优化，活化能是反应物到势垒的能量差，一般还要考虑零点振动能。 至于怎么优化反应物，看你使用的是什么量子化学方法。 如果是size consistent的方法，就可以分开来优化，分别计算A和B的能量和零点能，反应物的能量就是两者之和。 如果不是size consistent的方法，比如MRCI，就要放在一起优化，并且固定A和B两者之间的距离，一般放到20个Boh日左右就可以了。因为不满足size consistent的方法，E(A+B)不等于E(A)+E(B)。 对于size consistent，翻翻教科书吧。 [ 发自手机版 http://muchong.com/3g ] |
10楼2014-04-23 11:42:53
投票:
30