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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » RNA测序的问题
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馨の徽章

新虫 (初入文坛)

[求助] RNA测序的问题 已有1人参与

最近拿到了数字基因表达谱测序的数据，作为一个非生物专业的人，看到这些数据真的不知所措啊~~里边的GO富集和KEGG富集部分内容都看不懂，不明白什么意思，求大神帮助~想找点这方面的资料或书籍看一下，请问能给我推荐一下吗？
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1楼 2014-04-18 11:15:25
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馨の徽章

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 洛基殿下~ at 2014-04-18 17:09:12
GO富集，就是将表达差异显著的基因按照三大标准进行聚类（基因的功能，参与代谢的过程，基因产物的定位），然后你就可以根据您感兴趣的部分来寻找可能的基因，比如：你关心的是与细胞膜生成功能相关的性状，那么你将 ...

好的，谢谢~我想再找找这方面的文献看下，试试能不能搞明白~~不知道多久才能把文章搞定啊~~
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3楼2014-04-20 10:14:10
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洛基殿下~

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GO富集，就是将表达差异显著的基因按照三大标准进行聚类（基因的功能，参与代谢的过程，基因产物的定位），然后你就可以根据您感兴趣的部分来寻找可能的基因，比如：你关心的是与细胞膜生成功能相关的性状，那么你将关注点放在聚类到膜细胞膜生成的差异基因上。
KEGG富集，和GO富集很像，只不过是将表达差异显著的基因聚类到不同的代谢通路上。

如果你的疑问很多，建议你找测序的销售或者技术支持具体询问。我目前看的书是高山老师的《R语言与Bioconductor生物信息学应用》，在亚马逊上买的。
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2楼2014-04-18 17:09:12
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洛基殿下~

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引用回帖:
3楼: Originally posted by 馨の徽章 at 2014-04-20 10:14:10
好的，谢谢~我想再找找这方面的文献看下，试试能不能搞明白~~不知道多久才能把文章搞定啊~~...

这个就不好说了，如果你在测序前已经明确了想要解决的生物学问题，那么后续就比较快。但是如果测序前没想清楚的话，工程量就大些
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4楼2014-04-21 10:31:21
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灼璃之心

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

不知道您是什么背景的，如果不是做生物信息学的，那么理解起来可能比较困难。但是具体到某个项目上，或者说具体到paper里，那还是比较好解决的。。
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5楼2014-05-03 16:33:30
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