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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 分子模拟建模软件的选择
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零度不结冰

新虫 (小有名气)

[交流] 分子模拟建模软件的选择

用material studio做模拟建模是个很不错的选择，功能也很全，但是在计算键连接时经常会出现死机现象，不知道大家有没有遇到。
所以想知道大家还有什么比较好的建模软件可以用，最好对键连接的计算比较支持的。
本人主要做一些介孔分子筛模拟，原子数在几千左右。。
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1楼 2014-04-16 08:27:37
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huachao90

禁虫 (正式写手)
★
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本帖内容被屏蔽
2楼2014-04-16 08:57:33
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userhung

禁虫 (文学泰斗)

木虫博士
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
帮顶，blessing, blessing, blessing ! ~~~
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3楼2014-04-16 09:00:30
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xujc1983

木虫 (著名写手)

苦逼青椒一枚
★ ★
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月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-04-16 18:38:38
原子数几千的体系，键连接是什么意思？用的哪个模块？
MS里分子力学能做成键的只有GULP下的ReaxFF
量子力学的DMol和CASTEP连想也别想，DFTB+应该可以，但不知道有没有对应的参数库
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4楼2014-04-16 09:06:31
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零度不结冰

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by xujc1983 at 2014-04-16 09:06:31
原子数几千的体系，键连接是什么意思？用的哪个模块？
MS里分子力学能做成键的只有GULP下的ReaxFF
量子力学的DMol和CASTEP连想也别想，DFTB+应该可以，但不知道有没有对应的参数库

只是建模时计算键的连接形式，有个Bond calculation的计算功能，主要是根据几何距离来确定的，问题是原子多了一算就死机，很痛苦。。

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5楼2014-04-16 09:20:53
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hookah

木虫 (正式写手)
★
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一个比较好的方法是不要使用版本太高的materila visualize就可以了。版本高未必是好事情。
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6楼2014-04-16 09:23:30
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零度不结冰

新虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by hookah at 2014-04-16 09:23:30
一个比较好的方法是不要使用版本太高的materila visualize就可以了。版本高未必是好事情。

material visualisor有可以单独下载使用的吗？现在用的是ms6.0，建模真心费时费力。。

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7楼2014-04-16 09:30:57
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信之1973

银虫 (初入文坛)
★
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MS我用从未死过啊，我用的还是4.0版本的，是不是电脑问题？
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8楼2014-04-16 17:11:07
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风铃儿0608

木虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
我最近也在用ms做模拟，不过最近遇到个问题，5A 和13X分子筛模型怎么建呢？望楼主给点建议！

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9楼2014-04-16 18:09:42
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04010126

铁杆木虫 (知名作家)
帮顶
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不以物喜，不以己悲！
10楼2014-04-16 18:33:18
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