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xujc1983

木虫 (著名写手)

苦逼青椒一枚

[求助] fix shake后能量输出为-nan

如题,求助
很多CO2分子与基底的混合体系,打算固定C=O键长,但是用fix shake后,thermo输出的能量信息全是-nan,dump出的xyz坐标也是-nan
不作fix shake倒是可以,但是不符合模拟对应的情况
纯CO2体系里做同样fix,结果显示正常
不知哪位大侠能帮我解决这个问题
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xujc1983

木虫 (著名写手)

苦逼青椒一枚

★ ★ ★ ★ ★ ★
月只蓝: 金币+5, 感谢分享研究心得、问题的解决办法! 2014-04-13 09:01:48
月只蓝: 金币+1, 鉴于解决方法可能对其他虫子有帮助,本帖暂不关闭,感谢分享! 2014-04-13 09:03:38
貌似发现问题所在了
NPT计算的时候,damping系数太小了,但是结构迅速压缩,原子过于靠近
3楼2014-04-11 15:29:10
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查看全部 3 个回答

安德

铁杆木虫 (著名写手)

** *_** ___ ***_ * _*

虽然我不懂,但是帮你顶!
That'sit! Justdoit!
2楼2014-04-11 14:52:39
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