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mdp文件中“Output control”的参数设置？ 已有3人参与
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| 之前在运算完nvt和npt之后，生成的.trr文件都是30多G，怎么这么大呀，请教各位大神，是不是需要调节mdp参数里的“Output control”部分，让输出的文件变小一点？这个调整有什么规律吗？能根据步长的改变在之前的模板上相应倍数调整输出频率吗？谢谢！！ |
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5楼2014-04-08 14:06:45
lisuperyao
铁杆木虫 (职业作家)
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2楼2014-04-08 13:05:02
【答案】应助回帖
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感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+3, 感谢指导！ 2014-04-08 19:03:52
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+3, 感谢指导！ 2014-04-08 19:03:52
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1、RTFM 2、直接关掉.trr格式的文件输出，输出xtc文件就行了。 3、例如我的输出控制部分： ; OUTPUT CONTROL OPTIONS = ; Output frequency for coords (x), velocities (v) and forces (f) = nstxout = 0 nstvout = 0 nstfout = 0 ; Output frequency for energies to log file and energy file = nstlog = 1000 nstenergy = 1000 ; Output frequency and precision for xtc file = nstxtcout = 25000 xtc_precision = 100 看明白这几个参数的意义，根据自己的需求去调节 |
3楼2014-04-08 13:51:18
fangsteel
木虫 (正式写手)
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4楼2014-04-08 14:01:38