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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » 已知细菌属名种名，怎么查其属性，如降解有机物、偶氮降解、产电，产甲烷等等
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tina2013liti

新虫 (初入文坛)

[求助] 已知细菌属名种名，怎么查其属性，如降解有机物、偶氮降解、产电，产甲烷等等 已有1人参与

DNA测序结果用BLAST分析出来菌种名称及编号，怎样查他们的功能呢，如降解有机物、偶氮降解、产电，产甲烷等等，除了查文献，有没有好用的数据库，输入名称即可知其功能
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1楼 2014-04-07 10:48:36
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zhaozhibozhi

金虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by tina2013liti at 2014-04-08 10:19:01
是的是16SRRNA，有可信度问题，查文献，就是看看与该菌种相关的研究有哪些？《手册》在哪下载，怎么查呢，谢谢了...

伯杰氏第九版（英文）http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=7097477
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做一个阳光、开朗的小和尚
5楼2014-04-08 11:07:02
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zhaozhibozhi

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
dllchina: 金币+5, good~ 2014-04-08 11:54:40
1. DNA测序（难道是16S？）测序结果有一定可信度问题，请了解。

2. 确定了具体种，最好的方法是查找文献；当然《伯杰氏细菌系统学手册》或常见细菌鉴定手册上也是有的。
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做一个阳光、开朗的小和尚
2楼2014-04-07 20:58:07
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tina2013liti

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhaozhibozhi at 2014-04-07 20:58:07
1. DNA测序（难道是16S？）测序结果有一定可信度问题，请了解。

2. 确定了具体种，最好的方法是查找文献；当然《伯杰氏细菌系统学手册》或常见细菌鉴定手册上也是有的。

是的是16SRRNA，有可信度问题，查文献，就是看看与该菌种相关的研究有哪些？《手册》在哪下载，怎么查呢，谢谢了
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3楼2014-04-08 10:19:01
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zhaozhibozhi

金虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by tina2013liti at 2014-04-08 10:19:01
是的是16SRRNA，有可信度问题，查文献，就是看看与该菌种相关的研究有哪些？《手册》在哪下载，怎么查呢，谢谢了...

小木虫搜索伯杰氏手册，应该有下载。

我这有中文版《伯杰细菌鉴定手册》第八版，比较老：http://pan.baidu.com/s/1o617tI6；
有东秀珠的《常见细菌系统鉴定手册》，也挺老：http://pan.baidu.com/s/1ntsLRFN
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做一个阳光、开朗的小和尚
4楼2014-04-08 10:59:04
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