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tina2013liti

新虫 (初入文坛)

[求助] 已知细菌属名种名,怎么查其属性,如降解有机物、偶氮降解、产电,产甲烷等等 已有1人参与

DNA测序结果用BLAST分析出来菌种名称及编号,怎样查他们的功能呢,如降解有机物、偶氮降解、产电,产甲烷等等,除了查文献,有没有好用的数据库,输入名称即可知其功能
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zhaozhibozhi

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
dllchina: 金币+5, good~ 2014-04-08 11:54:40
1. DNA测序(难道是16S?)测序结果有一定可信度问题,请了解。

2. 确定了具体种,最好的方法是查找文献;当然《伯杰氏细菌系统学手册》或常见细菌鉴定手册上也是有的。
做一个阳光、开朗的小和尚
2楼2014-04-07 20:58:07
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tina2013liti

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by zhaozhibozhi at 2014-04-07 20:58:07
1. DNA测序(难道是16S?)测序结果有一定可信度问题,请了解。

2. 确定了具体种,最好的方法是查找文献;当然《伯杰氏细菌系统学手册》或常见细菌鉴定手册上也是有的。

是的是16SRRNA,有可信度问题,查文献,就是看看与该菌种相关的研究有哪些?《手册》在哪下载,怎么查呢,谢谢了
3楼2014-04-08 10:19:01
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zhaozhibozhi

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by tina2013liti at 2014-04-08 10:19:01
是的是16SRRNA,有可信度问题,查文献,就是看看与该菌种相关的研究有哪些?《手册》在哪下载,怎么查呢,谢谢了...

小木虫搜索伯杰氏手册,应该有下载。

我这有中文版《伯杰细菌鉴定手册》第八版,比较老:http://pan.baidu.com/s/1o617tI6
有东秀珠的《常见细菌系统鉴定手册》,也挺老:http://pan.baidu.com/s/1ntsLRFN
做一个阳光、开朗的小和尚
4楼2014-04-08 10:59:04
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zhaozhibozhi

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by tina2013liti at 2014-04-08 10:19:01
是的是16SRRNA,有可信度问题,查文献,就是看看与该菌种相关的研究有哪些?《手册》在哪下载,怎么查呢,谢谢了...

伯杰氏第九版(英文)http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=7097477
做一个阳光、开朗的小和尚
5楼2014-04-08 11:07:02
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