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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 怎么样在Lammps里面固定输出间隔，然后自动输出？
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Ballendtoo

银虫 (初入文坛)

[求助] 怎么样在Lammps里面固定输出间隔，然后自动输出？ 已有1人参与

比如400000步的程序，我希望每跑间隔50000步自动输出一个当时的盒子大小x, y, z 该怎么实现呢？

有做过的同学吗
谢谢大家了
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1楼 2014-04-03 17:39:15
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ysshj

金虫 (小有名气)
引用回帖:
14楼: Originally posted by Ballendtoo at 2014-04-17 20:07:17
我搭建了一个双层结构，请问可不可以用之前那个命令分别输出每一层的，lx ly lz呢？ 之前输出的是整体的，我这一共有9000多个原子...

variable command 里Group and Region Functions 的 bound（）好像可以输出某区域原子坐标的最大最小值，可以满足要求吗？
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一个人要像一支队伍。
16楼2014-04-21 16:12:56
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ysshj

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
Ballendtoo: 金币+2, ★★★很有帮助, 十分感谢~~~~~我先试试看，确实是需要输出lx ly lz 2014-04-03 19:05:55
月只蓝: 金币+2, 感谢指导！ 2014-04-07 09:54:16
Ballendtoo: 金币+3, ★★★★★最佳答案 2014-04-11 19:32:53
thermo         50000
thermo_style custom step lx ly lz xlo xhi ylo yhi zlo zhi
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2楼2014-04-03 18:39:21
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Ballendtoo

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by ysshj at 2014-04-03 18:39:21
thermo         50000
thermo_style custom step lx ly lz xlo xhi ylo yhi zlo zhi

你好，为什么跑程序出来的结果，lx ly lz会输出 -nan -nan -nan 是势能设置出了问题吗？ 求救~
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3楼2014-04-11 14:48:05
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ysshj

金虫 (小有名气)
★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-04-16 18:37:17
引用回帖:
3楼: Originally posted by Ballendtoo at 2014-04-11 14:48:05
你好，为什么跑程序出来的结果，lx ly lz会输出 -nan -nan -nan 是势能设置出了问题吗？ 求救~...

我只能说这种原因很复杂，导致出现除数很小的情况。
势函数如果按参考文献上的取，感觉一般不会有大错。
要不把in文件，data文件发上来大家看看？
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4楼2014-04-11 16:08:30
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