24小时热门版块排行榜    

查看: 3438  |  回复: 8
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

豆豆sk8

银虫 (小有名气)

[求助] 含双键二面角,柔性扫描势能曲线,计算到一半就出错(gaussian) 已有1人参与

各位大神,如题:
用gaussian对丁烯醛C-C=C-C二面角进行柔性扫描。之前使用相同的命令对C=C-C=O成功进行了扫描,但是换成这个中间是双键的二面角就老是出错。在我这里是计算到一般出错,在师兄那里是直接就报错,求指点
%chk=C:\g09w\tests\butenal 2(1.15)\3-24 opt=modredundant trans\notstandard\build structure.chk
# opt=modredundant b3lyp/6-311g(d,p) nosymm scf(maxcycle=300,qc) geom=connectivity

Title Card Required

0 1
C              
H                  1    1.09054186
H                  1    1.09432804    2  107.93359226
H                  1    1.09432776    2  107.93350013    3  115.33687104    0
C                  1    1.50239580    2  111.80729538    4  122.33147321    0
H                  5    1.08929069    1  117.01196721    2   -0.00383048    0
C                  5    1.33840408    1  125.49243777    2  179.99643945    0
C                  7    1.46865845    5  121.10962089    1  179.99971109    0
H                  8    2.18241339    7   26.46832174    5 -179.99972750    0
H                  8    1.11380015    7  114.35094064    5    0.00000000    0
O                  8    1.21028815    7  124.66829891    5  179.99783613    0

1 2 1.0 3 1.0 4 1.0 5 1.0
2
3
4
5 6 1.0 7 2.0
6
7 9 1.0 8 1.0
8 10 1.0 11 2.0
9
10
11

D 1 5 7 8 S 90 -4.00000000
回复此楼
Justskate
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

枪下游魂

木虫 (著名写手)

★ ★
gkf高: 金币+2 2014-04-03 11:15:10
引用回帖:
6楼: Originally posted by 豆豆sk8 at 2014-04-03 09:17:35
改了坐标,固定了一个键角...又出错了...也还是之前的问题,优化到最后就是结构错误。。。
Berny optimization.
Using GEDIIS/GDIIS optimizer.
Bend failed for angle     1 -     2 -     3
Tors failed  ...

看下是转到几度的时候停掉的
尝试把范围设成-180~180
7楼2014-04-03 11:06:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

枪下游魂

木虫 (著名写手)

出错原因是什么?
2楼2014-04-02 09:17:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

豆豆sk8

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2014-04-02 09:17:29
出错原因是什么?

刚才正在补充,结果断网了。。。
还想发个图片上来...
首先我看了一下这几次扫描的最后一个图,有一个C和H键是断开的。不知道是因为没有计算完所以断开了还是因为有断开的键才终止了计算。
另外,错误显示2070,最后几句话是:
Old curvilinear step not converged, using linear step
Error imposing constraints
Error termination via Lnk1e in C:\G09W\l103.exe at Thu Mar 27 22:47:20 2014.
Job cpu time:  0 days  2 hours 42 minutes 26.0 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=     10 Int=      0 D2E=      0 Chk=      9 Scr=      1
=======================================
现在能想到的方法就是:
1、师姐建议先换个计算方法和基组再算一下;
2、找个linux系统的gaussian计算一下;
========================================
Justskate
3楼2014-04-02 09:32:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gkf高: 金币+3 2014-04-03 11:15:04
引用回帖:
3楼: Originally posted by 豆豆sk8 at 2014-04-02 09:32:10
刚才正在补充,结果断网了。。。
还想发个图片上来...
首先我看了一下这几次扫描的最后一个图,有一个C和H键是断开的。不知道是因为没有计算完所以断开了还是因为有断开的键才终止了计算。
另外,错误显示2070, ...

这应该不是方法和基组的问题,换linux也会报错。
l103的错误大多数是来自于分子坐标和结构问题上。
首先你先看下在扫描碳链的时候相应的其他原子是否跟着一起旋转;
然后你要把需要跟着一起动的原子的相对位置固定;
另外可以尝试下改成笛卡尔坐标。
4楼2014-04-02 10:46:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 7/350 2026-08-31 00:21 by hZiFeudZyoGR
[基金申请] 为什么到现在没收到通知? +5 tannykie 2026-08-29 5/250 2026-08-30 21:05 by purplejack
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 zICmwzsBXjbN 2026-08-29 5/250 2026-08-30 20:08 by hZiFeudZyoGR
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 jCd0dEvKHShX 2026-08-29 4/200 2026-08-30 19:57 by hZiFeudZyoGR
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 jCd0dEvKHShX 2026-08-29 4/200 2026-08-30 19:35 by hZiFeudZyoGR
[论文投稿] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 G6APbkg8SA6w 2026-08-29 5/250 2026-08-30 19:01 by hZiFeudZyoGR
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 G6APbkg8SA6w 2026-08-29 5/250 2026-08-30 18:40 by hZiFeudZyoGR
[考博] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 5/250 2026-08-30 17:56 by hZiFeudZyoGR
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 7/350 2026-08-30 17:45 by hZiFeudZyoGR
[基金申请] 面上意见出来了 +9 黄鸟于飞Chao 2026-08-29 18/900 2026-08-30 16:47 by 黄鸟于飞Chao
[找工作] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 8/400 2026-08-30 12:14 by l0VvVHGBGRLv
[论文投稿] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +5 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 7/350 2026-08-30 11:51 by l0VvVHGBGRLv
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 4/200 2026-08-30 06:57 by ZPa0EcMwuECS
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+15) +15 晴天加油 2026-08-26 16/800 2026-08-29 18:28 by symmetry
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高,自己申请怎么就这么难 +12 Kittylucky 2026-08-27 13/650 2026-08-29 00:04 by superceng
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +5 叶九微 2026-08-26 5/250 2026-08-27 10:35 by l_zh2008
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +23 koalala 2026-08-24 26/1300 2026-08-26 14:29 by 宝贝虫子
[基金申请] 国际合作可查了,中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 某些机构,以效率低为荣,以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
信息提示
请填处理意见