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小小鑫000

铁虫 (小有名气)

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性别: MM
专业: 理论和计算化学

[求助] 怎样在MS中建立这三种金属团簇，会建的高手进来！

各位前辈，大家好：
最近在文献上看到三种Au13的团簇，分别如我下面上传的，可我不知道这个怎么在ms中构建，哪位高手会建，主要是详细讲一下建的步骤。
文献对这三种团簇的描述分别如下：
1.Particle 1L is planar and consists of 13 atoms belonging to the (111) surface (see Figure 1).
2.Particle 2L initially consisted of two layers of 4 and 9 atoms parallel to the (001)surface and with (111) side facets
3.particle 3L consists of three layers of 3, 7, and 3 atoms parallel to (111)

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好好研究，天天向上！

1楼2014-03-25 23:35:12

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

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专业: 金属材料的磨损与磨蚀
管辖: 第一性原理

【答案】应助回帖

★ ★
franch: 金币+2, 应助指数+1, 谢谢回帖交流。。。 2014-03-31 22:02:44

引用回帖:

10楼: Originally posted by 小小鑫000 at 2014-03-27 11:30:53
前辈，再一次感谢你，

我的这三个模型都做出来了，我现在在文献上看到Ni2到Ni13的这几个已经优化好后的模型图，现在想按照这些形状在ms里建一下它们的初始模型，我不知道该怎么下手，是用sketch atom 这个按钮 ...

我不确定文献中的团簇结构是不是优化得到的，如果这些结构是优化得到的，那么构建的时候稍微随意些无所谓，因为优化可以得到稳定的结构。如果这些团簇也是从晶体学数据切来的，并且没有进行优化或者由于计算过程constraint了这些坐标，那么还是要按前面的来。总之你可以按照原子数目从大到小逐渐去掉原子。另外，从计算成本来说，肯定是切出来的优化快一些。其实这些问题都不是什么问题，你需要自己摸索。