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windleakey

金虫 (小有名气)

[求助] PCR产物连T载体转化后,阳性率低 已有3人参与

RT,最近实验发现,PCR产物经纯化后连T载体,转化后阳性率总是很低,挑10个单克隆做PCR可能只有一个是阳性的,虽然能得到想要的,但还是觉得很奇怪,不知道是什么原因。
请问有大神知道吗?
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Lau_Kimura

铁虫 (正式写手)

蓝白斑筛选了没?
2楼2014-03-22 23:27:47
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wangguosing

金虫 (正式写手)

感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 应助指数-1, 没有帮助楼主解答问题,不能获得应助指数 2014-03-23 10:03:37
我也是,咋办,我的是氨氧化古菌的,怎么办
3楼2014-03-23 09:22:24
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西门吹雪170

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-03-31 19:57:53
转化效率很低,可以换种转化效率高的感受态细胞试试;也有肯能连接效率太低,建议变化一下体系的量,延长连接时间
植根于内心的修养;无需提醒的自觉;以约束为前提的自由;为别人着想的善良
4楼2014-03-23 10:05:02
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windleakey

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by Lau_Kimura at 2014-03-22 23:27:47
蓝白斑筛选了没?

没有筛啊,我们一般直接PCR筛,这次筛10个只有一个p出来
5楼2014-03-23 14:29:31
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windleakey

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by wangguosing at 2014-03-23 09:22:24
我也是,咋办,我的是氨氧化古菌的,怎么办

不知道咋回事,这次很幸运得到一个阳性,双酶切验证也正确了,可是也不能每次都靠幸运做实验啊
6楼2014-03-23 14:31:51
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windleakey

金虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 西门吹雪170 at 2014-03-23 10:05:02
转化效率很低,可以换种转化效率高的感受态细胞试试;也有肯能连接效率太低,建议变化一下体系的量,延长连接时间

转化应该没问题。主要还是连接的问题,是不是T载体什么问题,有些问题没有注意让T载体自连了
7楼2014-03-23 14:33:03
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西门吹雪170

荣誉版主 (职业作家)

引用回帖:
7楼: Originally posted by windleakey at 2014-03-23 14:33:03
转化应该没问题。主要还是连接的问题,是不是T载体什么问题,有些问题没有注意让T载体自连了...

可能性很大,所以要优化一下体系
植根于内心的修养;无需提醒的自觉;以约束为前提的自由;为别人着想的善良
8楼2014-03-23 17:11:47
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tu475575025

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
windleakey: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2014-03-24 12:32:05
gyesang: 金币+5, MolEPI+1, 鼓励回帖交流! 2014-03-31 19:58:23
没有遇到过这种情况,连T载体效率相当高,经常会做,每次随便挑一个白斑就是阳性,后来索性不用怎么验证了。你可以从以下方面一个个排查:
1、感受态和转化方法,用完整的质粒转化试试,如果转化效率很高,说明这部分没有问题。
2、确认你做pcr的酶是不是会加A,如果是的,再查下一项。
3、用T载自带的control insert 连接T截试试,如果出现效率很低,可能就是你的T截或者solution I 出问题了。
4、再要排查就要换新的T载和solution I试试了
ps:你说每次要挑10来个转化子才有一个阳性,转化子很多嘛,说明你的转化效率还是很高,只是很多是载体自连而已,这个可以用蓝白斑来排除呀。猜测是你连接时T载用量过多,插入片段量少了(如果T载正常全部是线性)。也可能是你的载体出问题了,连接前就有很多已经环化了(可以直接转1ul 没有连接的T载试试)。
9楼2014-03-23 21:32:29
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windleakey

金虫 (小有名气)

引用回帖:
9楼: Originally posted by tu475575025 at 2014-03-23 21:32:29
没有遇到过这种情况,连T载体效率相当高,经常会做,每次随便挑一个白斑就是阳性,后来索性不用怎么验证了。你可以从以下方面一个个排查:
1、感受态和转化方法,用完整的质粒转化试试,如果转化效率很高,说明这部 ...

谢谢建议,太认真了,打了这么多字,我会一一排查,再试试
10楼2014-03-24 12:32:41
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