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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 求助宏基因组高通量测序微生态研究
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ckenter

铁虫 (小有名气)

[求助] 求助宏基因组高通量测序微生态研究 已有4人参与

最近要做泡菜的微生态研究，就是想用宏基因组高通量测序代替pcr-dgge，但是对那一块我查文献都不知道从哪里下手，请问大虾们有谁做过这方面的啊。我主要做的是检测泡菜每个发酵阶段中微生物的主要种类，怎么提取总DNA啊，然后怎么做才可以拿出去测序呢
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1楼 2014-03-17 17:07:04
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洛基殿下~

捐助贵宾 (小有名气)
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引用回帖:
6楼: Originally posted by ckenter at 2014-03-18 19:22:31
我只想把DNA提出来然后pcr测序，测里面有哪些微生物种类，不需要克隆那么高端，就想知道里面有哪些酵母菌乳酸菌...

那这个用不上宏基因组测序，分子生态就行了，可以到种
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7楼2014-03-20 11:33:06
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匿名

用户注销 (初入文坛)
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2楼2014-03-18 16:02:09
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yipan

铜虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-03-18 18:54:42
所谓宏基因组学 (或元基因组学， metagenomics) 就是一种以环境样品中的微生物群体基因组为研究对象， 以功能基因筛选和/或测序分析为研究手段， 以微生物多样性、 种群结构、 进化关系、 功能活性、 相互协作关系及与环境之间的关系为研究目的的新的微生物研究方法。一般包括从环境样品中提取基因组 DNA, 进行高通量测序分析，或克隆DNA到合适的载体，导入宿主菌体，筛选目的转化子等工作。
可以选择核酸总提取试剂盒，具体可以参照不同公司产品的说明书。
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3楼2014-03-18 16:12:58
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洛基殿下~

捐助贵宾 (小有名气)
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研究种类的话，测分子生态就可以了。宏基因组可以检测到功能基因。
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4楼2014-03-18 16:18:29
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