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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Multiwfn » 初学Multiwfn者向大家请教，急急急。。。
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shuangliwang

铁杆木虫 (小有名气)

超级终结者

[求助] 初学Multiwfn者向大家请教，急急急。。。 已有1人参与

大家好，我在做电子密度差的时候遇到了下列问题，特向大家请教
这是我重复周老师的一篇文章，图片如下：
           初学Multiwfn者向大家请教，急急急。。。
下图是我做的：
           初学Multiwfn者向大家请教，急急急。。。-1
上面两幅图都是使用Multiwfn3.1输出Ne2的格点文件，然后利用GaussView 5.0观察的，使用的是同样的方法，但是周老师做的很精细，我做的特别粗糙，我查看了好久，不知道问题到地出现在什么地方？
           下面是我在做的过程中使用的基组和方法及关键词：
                    #CCSD/aug-cc-pVTz opt density out=wfn 6d 10f
如果各位大虫对这方面比较了解的话，请大家帮我解答！
谢谢大家！
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1楼 2014-03-14 16:32:12
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫
★ ★ ★
gkf高: 金币+3 2014-03-14 21:23:50
其实6d 10f关键词是多余的，完全不需要写。
估计问题在于Ne的原子波函数文件和Ne2的里的坐标不对应。
你用文本编辑器打开二聚体的.wfn文件，再打开第一个Ne和第二个Ne的原子波函数文件，看看原子坐标是否能和二聚体的对应上。
如果不是这个问题，建议把高斯输入输出文件和wfn文件都上传上来便于排查原因
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6楼2014-03-14 18:54:43
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zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

看来是要传相关文件了。

你没有加nosymm，为什么分子优化坐标极不对称？
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8楼2014-03-14 19:24:01
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shuangliwang

铁杆木虫 (小有名气)

超级终结者
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2楼2014-03-14 16:34:04
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shuangliwang

铁杆木虫 (小有名气)

超级终结者
周老师的的图片Ne与Ne之间有一部分是电子密度增加的区域，而我的并未出现！
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3楼2014-03-14 16:41:58
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zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gkf高: 金币+2 2014-03-14 21:23:42
从基组和方法及关键词看是没错的。
我猜测错在：Ne2是优化了的wfn，而作为相差的二Ne，却用的是初始输入的坐标。需要在GV中将优化的结果新写一个输入文件，用这里的二Ne坐标。
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4楼2014-03-14 17:40:27
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shuangliwang

铁杆木虫 (小有名气)

超级终结者
引用回帖:
4楼: Originally posted by zhou2009 at 2014-03-14 17:40:27
从基组和方法及关键词看是没错的。
我猜测错在：Ne2是优化了的wfn，而作为相差的二Ne，却用的是初始输入的坐标。需要在GV中将优化的结果新写一个输入文件，用这里的二Ne坐标。

周老师，你好！
      你提到的问题我之前也注意到了，上面的图片就是我使用GV看到的图景。
      He2优化后的参数如下：
    Ne2\\0,1\Ne,-0.0247937138,0.,0.\Ne,3.1237937138,0.,0.\\
      
      下面是我输入的数据：
     Ne_1       -0.024794    0.000000    0.000000
     
     Ne_2        3.123794    0.000000    0.000000     

利用Multiwfn得到density.cub文件，导入GV得到的就是上图。
     再次麻烦周老师了！
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5楼2014-03-14 18:49:17
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shuangliwang

铁杆木虫 (小有名气)

超级终结者
引用回帖:
6楼: Originally posted by sobereva at 2014-03-14 18:54:43
其实6d 10f关键词是多余的，完全不需要写。
估计问题在于Ne的原子波函数文件和Ne2的里的坐标不对应。
你用文本编辑器打开二聚体的.wfn文件，再打开第一个Ne和第二个Ne的原子波函数文件，看看原子坐标是否能和二聚 ...

Ne2                                                     
GAUSSIAN            110 MOL ORBITALS    144 PRIMITIVES        2 NUCLEI
  Ne   1    (CENTRE  1)   0.00000000  0.00000000  2.97498397  CHARGE = 10.0
  Ne   2    (CENTRE  2)   0.00000000  0.00000000 -2.97498397

Ne_1                                                   
GAUSSIAN             55 MOL ORBITALS     72 PRIMITIVES        1 NUCLEI
  Ne   1    (CENTRE  1)   0.00000000  0.00000000  0.00000000

Ne_2                                                   
GAUSSIAN             55 MOL ORBITALS     72 PRIMITIVES        1 NUCLEI
  Ne   1    (CENTRE  1)   0.00000000  0.00000000  0.00000000

坐标确实不对应，请问Sob 我应该如何调节呢？
           谢谢！
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7楼2014-03-14 19:21:30
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shuangliwang

铁杆木虫 (小有名气)

超级终结者
引用回帖:
8楼: Originally posted by zhou2009 at 2014-03-14 19:24:01
看来是要传相关文件了。

你没有加nosymm，为什么分子优化坐标极不对称？

周老师，你好！
       关键词nosymm我没有添加，我立刻调试一下，谢谢周老师！
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9楼2014-03-14 19:27:57
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shuangliwang

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超级终结者
引用回帖:
8楼: Originally posted by zhou2009 at 2014-03-14 19:24:01
看来是要传相关文件了。

你没有加nosymm，为什么分子优化坐标极不对称？

非常感谢周老师和Sob老师不厌其烦的讲解，现在我已经调试好了！
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10楼2014-03-14 20:44:30
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