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赵晓楠zxn

金虫 (初入文坛)

[求助] 基因扩不出来 已有4人参与

我有紫花苜蓿某个基因一段不完整的序列,blast结果显示蒺藜苜蓿与它同源性较高,为98%。根据蒺藜苜蓿完整的mRNA(大小为3310bp)设计引物,以紫花苜蓿的cDNA为模板,为什么扩不出来目的片段?
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西门吹雪170

荣誉版主 (职业作家)

★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-03-31 01:41:57
引用回帖:
5楼: Originally posted by 赵晓楠zxn at 2014-03-04 09:34:48
用同样的的模板扩过其他基因,能扩出来。至于引物,用过四对,出现过比它小1000bp的片段,其他引物都只产生了引物二聚体。退火温度,也试着降低过,仍旧扩不出来。ps:这个基因表达量不高,但是不至于扩不出来吧。...

根据你的描述,你扩增的片段一定很大吧?有用过LA Taq吗?这个酶是扩增长片段专用的,虽然说扩增出你目的基因的几率还是有点低,也可以试试看。感觉模板中含有你这个基因的可能性比较低,所以才可能导致扩不出来,建议问问老师或者师兄师姐
植根于内心的修养;无需提醒的自觉;以约束为前提的自由;为别人着想的善良
9楼2014-03-04 10:14:16
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西门吹雪170

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2014-03-04 08:42:12
赵晓楠zxn: 金币+3, 有帮助 2014-03-04 09:50:55
1、RNA抽的不好
2、引物设计的不好
3、实验操作技能可能存在问题
4、降低退火温度试试
植根于内心的修养;无需提醒的自觉;以约束为前提的自由;为别人着想的善良
2楼2014-03-03 19:02:01
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lvbobo823

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2014-03-04 08:42:15
赵晓楠zxn: 金币+3 2014-03-04 09:51:04
确定一下该基因表大么?再一个根据保守区段多设计几对引物,一定不要再UTR区域设计那地差异太大。
hehe
3楼2014-03-03 20:19:35
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acer_hp

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2014-03-04 08:42:19
赵晓楠zxn: 金币+3, 有帮助 2014-03-04 09:51:20
是不是太长了不好扩,要不换一种专门扩增长片段的酶,或者分两段扩增。
4楼2014-03-03 21:52:12
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