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分子动力学模拟“边界问题”含义 已有3人参与
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| 请问分子动力学模拟里的“边界问题”是什么意思？ |
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 MDs-Gromacs |
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【答案】应助回帖
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lmyiop: 金币+10, ★★★很有帮助 2014-03-04 12:18:55
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-03-04 16:53:59
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| 通俗地讲就是水盒子周期性边界喽，在动力学模拟中两个原子间距离小于14~12A 就视为存在相互作用力，在跑动力学时为了排除其他分子对本分子的干扰，假定存在一个水盒子，这个水盒子各边界到分子的距离都需要保证超过7~6A ，然后单独把这个水盒子和盒子里面的分子拿出来跑动力学，基本上这个体系就是一个那个什么孤立体系，这种简化设定就是所谓的周期性边界，就是一种简化计算的方法而已 |
7楼2014-03-03 21:31:57
2楼2014-03-02 10:13:30
3楼2014-03-03 09:13:03
4楼2014-03-03 09:13:17