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slandp

金虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 茕茕恭煮 at 2014-02-26 20:15:29
泛函对我这个体系构型影响较大,最好还是不要换了。请问我是用越接近过渡态的构型作为初始构型越好吗?...

你已经基本确定了过渡态的构型了吗?如果仅仅是把出错后的最后一步构型Restart,出错的概率很大,很有可能四个循环不到就挂了,因为看起来不像是超出最大步数不收敛。我的想法是要么重新考察过渡态的初始构型,当然如果你有把握现在的构型很接近了,可以对构型进行微调,包括你想定义的原子之间的成键方式。
嗯~初始构型嘛,当然是越接近越好,巴不得一开始就完全猜中构型呢,但前提是过渡态的构型是准确的,这个,很难把握吧?
11楼2014-02-27 16:53:54
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茕茕恭煮

木虫 (正式写手)

引用回帖:
9楼: Originally posted by youyno at 2014-02-26 20:18:06
把输出结果最后部分贴出来一下

Electronic spatial extent (au):  <R**2>=          34646.6282
Charge=              0.0000 electrons
Dipole moment (field-independent basis, Debye):
    X=             -5.1327    Y=             -0.1697    Z=             -0.0453  Tot=              5.1357
Quadrupole moment (field-independent basis, Debye-Ang):
   XX=           -330.2040   YY=           -348.4399   ZZ=           -332.6923
   XY=             -0.2050   XZ=              0.3307   YZ=            -26.5446
Traceless Quadrupole moment (field-independent basis, Debye-Ang):
   XX=              6.9081   YY=            -11.3278   ZZ=              4.4198
   XY=             -0.2050   XZ=              0.3307   YZ=            -26.5446
Octapole moment (field-independent basis, Debye-Ang**2):
  XXX=            -19.5929  YYY=            -14.6631  ZZZ=             -1.1930  XYY=           -194.0669
  XXY=              5.3189  XXZ=              1.8255  XZZ=             -0.9392  YZZ=             -3.0525
  YYZ=             -5.4466  XYZ=            -66.9978
Hexadecapole moment (field-independent basis, Debye-Ang**3):
XXXX=         -22313.1829 YYYY=         -15805.0116 ZZZZ=          -6734.8484 XXXY=             -3.0344
XXXZ=             -7.9396 YYYX=            -27.2481 YYYZ=           -507.5349 ZZZX=              4.9956
ZZZY=           -255.4976 XXYY=          -7029.8297 XXZZ=          -4805.0298 YYZZ=          -3878.5066
XXYZ=           -185.3276 YYXZ=              9.4335 ZZXY=              3.5413
N-N= 8.859679071601D+03 E-N=-2.346623308869D+04  KE= 2.459633905308D+03
No NMR shielding tensors so no spin-rotation constants.
Leave Link  601 at Wed Feb 26 03:46:35 2014, MaxMem=   536870912 cpu:        28.8
(Enter /export/home/gaussian/g09_D01_em64t/g09/l9999.exe)


IT MATTERS NOT HOW DEEP YOU PLOW,
BUT HOW LONG YOU STAY IN THE FURROW.
Error termination request processed by link 9999.
Error termination via Lnk1e in /export/home/gaussian/g09_D01_em64t/g09/l9999.exe at Wed Feb 26 03:46:35 2014.
Job cpu time:       6 days  2 hours 55 minutes 27.5 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=   9492 Int=      0 D2E=      0 Chk=     69 Scr=      1
我爱我的家~~~
12楼2014-02-27 17:22:04
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茕茕恭煮

木虫 (正式写手)

引用回帖:
9楼: Originally posted by youyno at 2014-02-26 20:18:06
把输出结果最后部分贴出来一下

结果已经贴出来了一部分,如果需要其它信息,可以把log文件贴上来~~~拜托帮我看看,嘻嘻
我爱我的家~~~
13楼2014-02-27 17:23:06
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茕茕恭煮

木虫 (正式写手)

引用回帖:
10楼: Originally posted by 飞行鸟 at 2014-02-26 21:07:25
应该是你的初始结构不合理造成的

怎样的结果才算是合理呢?我不了解过渡态,只知道过渡态不稳定。我这个分子有两种构型,扫描势能面的结果是在两种构型中间有个势垒,我就直接把势垒所对应的构型当做初始结构了,请问这样合理吗?
我爱我的家~~~
14楼2014-02-27 17:25:11
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