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ice清玉

新虫 (初入文坛)

[求助] 同样的PCR产物,琼脂糖凝胶电泳时而有带时而没带,但marker每次都清晰 已有10人参与

做3' 端race,PCR产物跑胶没有带,在冰箱4℃放了一天,第二天随手又跑了一次胶,竟然有带了,两次跑胶marker都很清晰。我以为这只是一个巧合,后来这种事情竟然发生了多次!头天做了PCR跑胶检测后有条带,放冰箱第二天再检测又没有带了!同样的,两次marker都清晰。还有一次,5' 端race,PCR之后检测没有条带,我死马当活马医依然跑胶准备回收,条带竟然又出来了,还很清晰....之前一直以为是PCR有问题,现在想想应该是胶有问题吧...可是问题在哪儿呢...TAT
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RNAPROTEIN

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
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ice清玉(gyesang代发): 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-02-23 23:53:47
有可能是放冰箱之后酶继续催化PCR 反应,如果是你PCR反应的循环次数不够的话,那么P完之后很可能因为copy数少而不能用肉眼看到条带,放冰箱一段时间之后酶可能会继续催化反应(反应应该很慢,但由于PCR是成指数增长,所以哪怕是增加了2-3个反应,你的产物的copy数都会成指数增加),导致你再次跑胶时能看到条带。这纯属个人设想,仅供参考。
16楼2014-02-22 14:09:19
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yyshpy007

禁虫 (正式写手)

感谢参与,应助指数 +1
本帖内容被屏蔽

2楼2014-02-20 13:45:29
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ice清玉

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by yyshpy007 at 2014-02-20 13:45:29
这么诡异,头回听说,肯定是你第一次跑胶时某些部分出问题了 ,比如配胶,染料等,你比对一下就知道了

我们实验室称量多少琼脂糖,加多少染料都写得清清楚楚贴在墙上的...TAT...一开始我也觉得是我配胶的问题,可是marker都很清晰啊...我也觉着诡异啊...难道就这样碰运气才能碰上哪次有条带我才能回收吗...太悲催了吧...
3楼2014-02-20 13:52:36
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jiaolong11a

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
难道你的EB分布不匀导致的,好可怕
多情总被无情扰。。。愁
4楼2014-02-20 14:26:36
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