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tmoonday

金虫 (小有名气)

[求助] 简并引物PCR扩增问题 已有5人参与

各位虫友好,敝人这段时间一直苦于基因克隆问题上,希望高人能够不吝赐教。请问各位大仙一般用简并引物扩增基因时的反应程序是什么啊,50ul体系各个成分的量一般怎么组合啊?谢谢啦
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西门吹雪170

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
tmoonday: 金币+2, 有帮助, 试试啊 2014-02-18 13:24:56
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-02-18 18:00:28
10X LA Buffer:5uL
dNTP:4uL
上游:2uL
下游:2uL
模板:1uL
LA Taq:0.5uL
加水至50uL

1、94℃ 2min
2、94℃ 30sec
3、54℃ 30sec    此温度根据自己的引物进行调节
4、72℃ 2min     延伸时间根据扩增的片段大小进行调节   
5、72℃ 10min
2-4共35 cycles
植根于内心的修养;无需提醒的自觉;以约束为前提的自由;为别人着想的善良
2楼2014-02-18 13:13:51
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3楼2014-02-18 14:00:25
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hellolin

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流经验! 2014-02-18 17:59:56
体系和普通PCR差不多,关键是退火温度,我们一般用40-45℃
scienceguy
4楼2014-02-18 14:03:17
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forrestgump

新虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-02-18 18:00:02
简并引物的退火温度最好用TD-PCR,再搞巢shiPCR
5楼2014-02-18 14:16:47
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鬼羽帝魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-02-18 18:00:15
你想用哪个酶进行扩增??如果选定了那个酶,那么你买酶的时候就会带着说明书的,按上面的做。
扩增的时候我一般加甜菜碱(50ul的体系里面加5ul5M的甜菜碱),效果比较好。不加也可以。
6楼2014-02-18 16:59:06
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dameng198400

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by hellolin at 2014-02-18 14:03:17
体系和普通PCR差不多,关键是退火温度,我们一般用40-45℃

温度那么低的话,会不会二聚体太多?
7楼2014-08-29 09:59:15
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爱上鱼……

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

我按平常的pcr条件就做出来了,结果没啥区别哦。
懒病又犯了……
8楼2014-08-29 11:07:17
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hellolin

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
7楼: Originally posted by dameng198400 at 2014-08-29 09:59:15
温度那么低的话,会不会二聚体太多?...

不会的,扩出来没问题
scienceguy
9楼2014-08-30 21:24:51
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