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5‘Race验证miRNA靶点的原理 已有2人参与
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大家好,近期内急需做验证miRNA靶点的实验,考虑要用RACE,但是首次接触,感觉很多问题想不明白, 头都要涨破了,于是在自己继续摸索的同时,想请有这方面经验的虫友赐教,先表示感谢 ![]() 1.我研究的物种是一个基因组没测过序的,但有其对应的转录组,这样可否进行实验验证? 2.如果可以,那么动物miRNA怎么在对应的转录本里找寻相对应的靶标序列(种子序列完全互补?其余序列 允许几个错配?大概需要上下几kb?)? 3.miRNA应该跟mRNA 3‘UTR结合,那为什么要用5’RACE (主要是扩5‘UTR),而不是用3’URT?是因为反转录 出来的cDNA跟实际的mRNA是互补的吗?如果是这样,那么特异性引物设计的时候应该是跟mRNA序列一致 的而非反向互补吧。 4.具体试剂盒考虑买Takara的,不知道其效果怎样?大概多久能出结果? 5.有没有动物中做5‘RACE验证miRNA靶标相关的文献可以推荐? 这些问题时本人怀着极其虔诚而又焦虑的心情写下的,怕写少了,见这不明所以;写的多了,又觉啰嗦,请亲们不吝赐教吧! 搬个小板凳在线等~~~ ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() : |
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23楼2014-02-26 13:38:27

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