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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 高斯算频率的问题
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绍敏郡主

木虫 (著名写手)

[交流] 高斯算频率的问题

用高斯算频率，已经算了半个月了，算到下面这个地方以后已经好几天不动了。但是看rwf文件还是在运行，几分钟就更新一下。

   11 vectors produced by pass141 Test12= 7.04D-13 1.00D-09 XBig12= 1.92D-14 2.82D-09.
      9 vectors produced by pass142 Test12= 7.04D-13 1.00D-09 XBig12= 1.02D-14 1.72D-09.
      2 vectors produced by pass143 Test12= 7.04D-13 1.00D-09 XBig12= 5.62D-15 1.26D-09.
Applied DIIS recursively to reduced A of dimension  7649.

我之前用top命令可以看到任务在运行，奇怪的是昨天晚上突然在top那里看不到那个任务了。现在rwf文件还是像以前一样几分钟就更新一下。
另外，这个任务我分配了16G内存。但是现在从top命令那里看几乎所有的100G内存都被占用了。
不知是怎么回事？
谢谢。
（主要是两个问题，第一个是top看不到任务了，第二个是为什么所有内存都被占用了）

当然还有一个最重要的问题，我那个任务还在运行吗？

高斯算频率的问题
屏幕快照 2014-02-15 下午7.14.09.png
高斯算频率的问题-1
屏幕快照 2014-02-15 下午7.39.23.png

[ Last edited by 绍敏郡主 on 2014-2-15 at 18:41 ]
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1楼 2014-02-15 18:15:14
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绍敏郡主

木虫 (著名写手)
为了弄明白那个任务还在不在运行，我试了一下kill命令，任务好像被被杀掉了（之前被占用的100g内存也释放出来了）。
现在不明白为什么top查不到那个任务？还有为什么突然占用了所有的内存？
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2楼2014-02-15 20:55:34
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smutao

禁虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
绍敏郡主: 金币+2 2014-02-15 21:28:08
gmy1990: 金币+1 2014-02-16 00:17:50
本帖内容被屏蔽
3楼2014-02-15 21:23:53
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绍敏郡主

木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by smutao at 2014-02-15 21:23:53
使用
ps -e | grep g09
查看任务在不在了

谢谢，我刚才用ps+PID查了查，我看不懂那个状态是活的还是死的，查出来的状态里面不是有一项时间吗，我在不同的时候查，那个时间总是那个数。我以为不运行了，就用了kill，然后发现被杀死了。
赞一下 回复此楼
4楼2014-02-15 21:28:01
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
绍敏郡主: 金币+2, 谢谢 2014-02-16 00:28:44
引用回帖:
4楼: Originally posted by 绍敏郡主 at 2014-02-15 21:28:01
谢谢，我刚才用ps+PID查了查，我看不懂那个状态是活的还是死的，查出来的状态里面不是有一项时间吗，我在不同的时候查，那个时间总是那个数。我以为不运行了，就用了kill，然后发现被杀死了。...

ps -e | grep g09还在就还在运行。
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5楼2014-02-16 00:14:04
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清新俊逸

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
绍敏郡主: 金币+4, 谢谢 2014-02-19 16:24:04
1、top里面查看的内存used是没有意义的。因为写文件的时候，文件同时会在内存里cached，文件删掉了它就释放了。
你这里虽然有98731416是used，但其中有84657864是cached，因此实际使用的很少。

2、读写文件的时候，cpu利用率很低，可能进程处于D状态，top的时候，按i就能显示出来。或者用ps -u studends也能看到你的进程。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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6楼2014-02-19 15:21:28
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