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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 巴德电荷bader charge 接VASP计算结果出问题
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liu108

木虫 (正式写手)

[求助] 巴德电荷bader charge 接VASP计算结果出问题已有1人参与

按照VASP计算bader charge的方法去计算TiB2的bader charge，但是计算结果显示，C2v构型的TiB2的两个硼原子的bader charge相差很大。
巴德电荷bader charge 接VASP计算结果出问题
上图所示为两种不同构型的TiB2的结构以及电荷密度图。从图上看，在两种构型中，两个硼原子的电荷密度是一样的。但是，第二种构型所计算的两个硼原子的bader charge却相差很大。前一种构型中两个硼原子的bader charge分别为-0.379 和 -0.386 |e|。后一种构型中两个硼原子的bader charge分别为-0.076 和 -0.112 |e|。
我将FFT网格点增大了三倍后再计算时，结果还是没有变化。纠结了，恳求各位大牛帮忙。
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会当凌绝顶，一览众山小。
1楼2014-02-12 17:40:28
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liu108

木虫 (正式写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by hakuna at 2014-02-15 11:56:20
还有两点你考虑一下：
1.对于原子、分子或团簇，计算时只考虑gamma点，所以你的KPOINTS需要改一下。
2.由于VASP计算时模型是周期性的，你检查一下你的slab扩展开后，两个B原子的周围环境是否相同；如果我构造这个 ...

问题解决了，多谢你的帮助，你点击一下应助回帖，不然没办法给你金币。
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会当凌绝顶，一览众山小。
10楼2014-02-19 16:05:51
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普通回帖

甲斐之虎

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流 2014-02-13 22:07:10
liu108: 金币+20, ★有帮助, 下面的大神没有应助回帖，给不了他金币，金币都给你了，呵呵。 2014-02-20 10:01:45
按照VASP计算bader charge的方法去计算TiB2的bader charge
能否把计算的过程和处理过程贴出来？会不会是计算过程出现了问题？
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

liu108
别人笑我太疯颠，我笑他人看不穿。不见五陵豪杰墓，无花无酒锄作田。
2楼2014-02-13 19:20:34
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liu108

木虫 (正式写手)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by 甲斐之虎 at 2014-02-13 19:20:34
按照VASP计算bader charge的方法去计算TiB2的bader charge
能否把计算的过程和处理过程贴出来？会不会是计算过程出现了问题？

谢谢你的回复，我在做静态计算时的INCAR和POSCAR及KPOINTS如下
INCAR
SYSTEM=TiB2
ISTART=0
ICHARG=2
PREC=high
EDIFF=0.1E-04
EDIFFG=-0.01
ENCUT=600
ISMEAR=0
SIGMA=0.2
GGA=PE
NSW=0
IBRION=-1
NGXF=500
NGYF=500
NGZF=500
LAECHG=.TRUE.
LCHARG=.TRUE.
LREAL=.FALSE.

POSCAR

TiB2
   1.00000000000000
    15.0000000000000000    0.0000000000000010    0.0000000000000010
     0.0000000000000000   15.0000000000000000    0.0000000000000010
     0.0000000000000000    0.0000000000000000   15.0000000000000000
   B    Ti
   2   1
Direct
  0.5372743501317421  0.4983374175634400  0.5752677821194272
  0.4786552045049751  0.5585467011596867  0.5160776570671757
  0.4554252184555273  0.4308965726291220  0.4984991172448628


KPOINTS

Automatic generation
0
Monhkorst-pack
3 3 3
0 0 0

静态计算结束后，用chgsum.pl去处理，具体过程为./chgsum.pl AECCAR0 AECCAR2
得到CHGCAR_sum
然后用./bader CHGCAR -ref CHGCAR_sum得到ACF.dat。
得到的ACF.dat如下

    #         X           Y           Z        CHARGE     MIN DIST    ATOMIC VOL
--------------------------------------------------------------------------------
    1      8.6418      8.1354      7.3821      2.9383      0.5452   1011.1276
    2      8.6241      6.5947      7.3371      3.9345      0.8346   1095.7908
    3      6.8272      7.3846      7.3998      3.1272      1.0500   1268.0815
--------------------------------------------------------------------------------
    VACUUM CHARGE:               0.0000
    VACUUM VOLUME:               0.0000
    NUMBER OF ELECTRONS:        10.0000
还望指教
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会当凌绝顶，一览众山小。
3楼2014-02-14 08:37:51
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甲斐之虎

银虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by liu108 at 2014-02-14 08:37:51
谢谢你的回复，我在做静态计算时的INCAR和POSCAR及KPOINTS如下
INCAR
SYSTEM=TiB2
ISTART=0
ICHARG=2
PREC=high
EDIFF=0.1E-04
EDIFFG=-0.01
ENCUT=600
ISMEAR=0
SIGMA=0.2
GGA=PE
NSW=0
IBRION=-1
...

EDIFFG=-0.01
去掉，静态计算不需要
PREC=high
改为PREC = Accurate
不过可能不是这两个的原因，坐等大神出现吧
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别人笑我太疯颠，我笑他人看不穿。不见五陵豪杰墓，无花无酒锄作田。
4楼2014-02-14 09:08:26
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liu108

木虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 甲斐之虎 at 2014-02-14 09:08:26
EDIFFG=-0.01
去掉，静态计算不需要
PREC=high
改为PREC = Accurate
不过可能不是这两个的原因，坐等大神出现吧...

谢谢回复。ACF.dat里面两个硼原子的原子体积也有差别，我觉的这个bader charge不相同也有关系，但不知道怎样改才能使的原子体积相同啊。
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5楼2014-02-14 10:11:24
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hakuna

木虫 (知名作家)
第二种情况有偶极矩，你坐下偶极矩校正试试看
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6楼2014-02-14 14:39:55
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liu108

木虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by hakuna at 2014-02-14 14:39:55
第二种情况有偶极矩，你坐下偶极矩校正试试看

行不通啊，在静态计算中加上了偶极距矫正，但是bader charge还是相差很大啊。
做法是在INCAR中加了IDIPOL和LDIPOL项。IDIPOL项中试了1到4都不行。
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7楼2014-02-15 11:19:13
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hakuna

木虫 (知名作家)
引用回帖:
7楼: Originally posted by liu108 at 2014-02-15 11:19:13
行不通啊，在静态计算中加上了偶极距矫正，但是bader charge还是相差很大啊。
做法是在INCAR中加了IDIPOL和LDIPOL项。IDIPOL项中试了1到4都不行。...

还有两点你考虑一下：
1.对于原子、分子或团簇，计算时只考虑gamma点，所以你的KPOINTS需要改一下。
2.由于VASP计算时模型是周期性的，你检查一下你的slab扩展开后，两个B原子的周围环境是否相同；如果我构造这个模型，我会让BTiB角的平分线与a或b平行，也即TiB2的C2轴平行于a或b，在计算时沿a和b方向的边长取为不相等，INCAR里加入ISYM，去掉对称性。
仅供参考
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8楼2014-02-15 11:56:20
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liu108

木虫 (正式写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by hakuna at 2014-02-15 11:56:20
还有两点你考虑一下：
1.对于原子、分子或团簇，计算时只考虑gamma点，所以你的KPOINTS需要改一下。
2.由于VASP计算时模型是周期性的，你检查一下你的slab扩展开后，两个B原子的周围环境是否相同；如果我构造这个 ...

谢谢你的回复，试过你说的两种方法了，计算的结果还是跟原来一样。迷茫了啊。。。
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9楼2014-02-17 09:41:48
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